棉花糖制作机是台像个大碗的机器，机器的中心部位是一个温度很高的加热腔，热量打破了晶体的结构，将糖变成了糖浆。加热腔中有一些比颗粒蔗糖尺寸还小的孔。当糖在加热腔中高速旋转的时候，离心力将糖浆从小孔中喷射到“大碗”的周围。由于液态物质遇冷凝固的速度和它的体积有关，体积越小，凝固得越快。因此，研究人员把加热腔中的小孔直径设计得很小，只有50微米，从小孔中喷射出来的糖浆马上就凝结成固态的糖丝，不会粘在一起。
快速的冷却让蔗糖分子之间没有时间排列整齐，因此孩子们手中的那个巨大蓬松的棉花糖再也不是晶体了，而是由无数线状的玻璃状的糖组成的。用稍微专业的话来说，蔗糖的晶体结构已经被棉花糖制作机破坏掉了，蔗糖分子的排列不再有规律了，而是比较杂乱无章。这种结构的变化可以用熔点测试出来，蔗糖分子有特定的熔点，在受热熔解时温度不再变化；而棉花糖丝没有特定的熔点，熔解时温度会逐渐上升。
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