PCR跑胶,目的条带很亮,但是边沿不清楚,前后有拖尾现象,请教各位是什么原因?

PCR跑胶,目的条带很亮,但是边沿不清楚,前后有拖尾现象,请教各位是什么原因?

博凌科为-为你解答:1模板可能有降解,建议避免反复冻融,放置时间不能太长。模板的质量是最重要的。2抽提RNA时有污染,包括基因组DNA污染和蛋白质污染,需重 做抽提。3提高退火温度,减少非特异性扩增。4减少循环次数,减少非特异性扩增。5电泳缓冲液时间太长,ph值和盐离子浓度明显 改变。6电泳时电压不能太高,8V/cm。7一般来讲,基于promega和TaKaRa的PCR反应体系中,Mg和dNTP的浓度是相 匹配的,不需改动。8 加样量过大。过多的量会造成加样孔超载,从而导致拖尾和弥散,对于较大的DNA此现象更明显。9制胶过程中胶孔没 制好。10 EB没有冲洗干净。11模板混有基因组DNA,或模板中混有蛋白。12非特异反映。引物设计的不好,非特异,这种情 况容易出现非特异扩增造成有非特异性扩增带或拖尾现象。13电泳液用久了不换,电泳胶脏了 。14扩增的条件不合适,一般退火温度低时容 易使引物在非特异位置结合引发扩增反应造成拖尾。针对以上情况,可以先提高退火温度试试,如果实在不行,再看看引物是不是合适。如果 内参可以扩出来,只能说明程序可能是适合的,但不能完全说明体系合适。体系内的各组分,如模板、dNTP、Mg离子、引物等都可能造成拖尾。先得考虑换了 那种成分后出现了拖尾,逐项试验。引物当然是最重要的因素,但绝非造成拖尾的唯一原因。而且,一般而言,拖尾不会是引物的问题,尤其是已经被用过证明能扩 出特异片段的 引物,更不可能是它的问题了。先不要加Taq酶,等到其他东西都加完了以后,放到PCR仪上去,到那时再加,马上开启PCR程序试试。检 查一下你的dNTP的量够不够。适当减少2~3个循环试试,可能会有效果。
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