1. 你之前从质粒上能P出来，质粒还有么，要不然用质粒做个正对照？质粒能P出来，
基因组P不出来，可能是基因组的质量不太好。
2. 你做的时候带上一个你能做出PCR的正对照，表明你一次操作的正确性。
3. 换
Taq酶试试，看看是不是你的酶问题（因为Taq酶的保真性不高），看看能不能P出来，如果能，建议直接换NEB 的 phusion做PCR，我用过的PCR酶中，phusion的保真性和扩增效率相对其他而言都是最好的。
质粒应该更容易扩增出目的片段，你用你的质粒做模板做个梯度PCR看看能不能出有没有出目的带的，若梯度没出估计你第一次出带有可能有污染。