银行承兑汇票丢失后可以通过挂失止付、公示催告等方式来保护自己的权利。
我国《票据法》第十五规定：票据丧失，失票人可以及时通知票据的付款人挂失止付，但是，未记载付款人或者无法确定付款人及其代理人付款人的票据除外。收到挂失止付通知的付款人，应当暂停支付。失票人应当在通知挂失止付后三日内，也可以在票据丧失后，依法向人民法院申请公示催告，或者向人民法院提起诉讼。
持票人将银行承兑汇票丢失后，应及时去付款行通知其止付，或者迅速向法院申请公示催告，由法院向银行下达停止支付通知书。
如果是由托收行丢失的,银行会按照固定标准赔偿资金延误损失。
丢失银行承兑汇票的持票人（失票人）通知银行挂失止付的程序为：
失票人到付款人或代理付款人处申请挂失止付，填写《挂失止付通知书》（图一）并加盖失票人公章、财务章、人名章。同时提供以下文件（以民生银行为例）：营业执照副本、组织机构代码、开户许可证、法定代表人和经办人的身份证复印件。
失票人应在通知挂失止付后，向人民法院申请公示催告或提起诉讼；人民法院决定受理申请的，应在12日内以停止支付通知书形式，通知付款行停止支付；在12日内未收到法院止付通知书，如有人持所丧失的票据要求付款，银行予以付款的，不承担任何责任。
公示催告程序为：
第一，申请公示催告。失票人向票据付款地的基层人民法院提出公示催告的申请（图二）。其中银行承兑汇票的付款为代理付款人或出票人所在地；银行本票的付款地为出票人所在地；商业承兑汇票的付款地为承兑人所在地；支票的付款地为付款人所在地。
第二，受理并公告。法院经审查决定公示催告后，发出《停止支付通知》（图三）要求票据付款人暂停支付，并在3日内以书面形式发出公告（图四），督促利害关系人申报权利；公示催告的时间由人民法院决定，最长不超过60日；在公示催告期间，票据转让的行为无效，收到止付通知的付款行和代理付款行不予付款。
第三，申报权利。利害关系人在公示催告期间，可以向人民法院申报权利；人民法院对符合条件的申报，应裁定终结程序，向申请人和付款人发出通知，由票据权利人凭法院通知向付款申请人请求付款。
第四，除权判决。公示催告无人申报权利的，申请人应自申报权利期间届满的次日起，一个月内申请法院做出判决；人民法院根据申请人的申请，宣告票据无效。自判决公告之日起，失票人重新获得票据权利，有权请求付款人付款。
如果公示催告的权利申报人与付款人的权利发生冲突，可由申请人或付款人向人民法院提起诉讼，失票人也可直接向人民法院提起诉讼；提起诉讼的人民法院受理后，即终结公示催告程序，通知申请人和付款人后转入民事诉讼程序；提起诉讼的被告具有特殊性，既可以是付款人，也可以是持票人、背书人、保证人等其他票据债务人；在普通诉讼中，票据丧失期间的转让行为只要符合票据法规定的条件和方式，转让行为有效，善意持票人的票据权利受到保护。
失票人要求银行付款的程序：
经过挂失止付和除权判决，失票人即可向付款人要求付款。在北京市以在民生银行要求付款为例，要求付款时，需提交以下文件：
1、要求付款的书面说明（付款申请书）（图五）
2、法院做出的《除权判决书》
3、代办人身份证复印件
4、之前办理挂失时，由客户留存的《挂失止付通知书》客户留存联
提交的上述文件经银行审核后，银行将以转账的形式付款。
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