要分“短期病假”和“长期病假”：职工因病或非因工负伤连续休假在六个月内的称为“短期病假”，超过六个月的称为“长期病假”。根据劳动部《关于加强企业职工疾病休假管理保障职工疾病休假期间生活的通知》规定，职工患病六个月以内的：(1)连续工龄不满二年的，按本人工资的60%计发;(2)连续工龄满二年不满四年的按本人工资的70%计发;(3)连续工龄满四年不满六年的按本人工资的80%计发;(4)连续工龄满六年不满八年的按本人工资的90%计发;(5)连续工龄满八年及以上的按本人工资的100%计发。职工可依据他的工龄按照相应的比例计算她病假期间应得的病假工资。而如果职工患病超过六个月以上的：(1)连续工龄不满一年的按本人工资的40%计发;(2)连续工龄满一年不满三年的按本人工资的50%计发;(3)连续工龄满三年及以上的按本人工资的60%计发。(这里的本人工资指职工正常情况下实得工资的70%。)(4)职工的疾病待遇低于企业月平均工资的40%，企业应按照用人单位依法制定的规章制度给予职工相应补助。(5)职工的病假工资高于本市上年度月平均工资的，可按本市上年度月平均工资计发。注意：各地实施细则的规定不尽相同，也不都如此细致，具体病假工资支付比例可咨询当地人力社保部门。无论如何病假期间的工资都不应该被全部扣完，但只要不是长期病假，综合计算下来的话，病假工资也不会太多，所以，最为理智的方法还是当面和公司索要或进行举报，因为一旦申请仲裁也很不利于员工以后的工作，而且仲裁费以及其他费用可能比工资都多。
《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》第四条职工患病，医疗期内停工治疗在6个月以内的，其病假工资按以下办法计发：（一）连续工龄不满10年的，按本人工资的70%发给；（二）连续工龄满10年不满20年的，按本人工资的80%发给；（三）连续工龄满20年不满30年的，按本人工资的90%发给；（四）连续工龄满30年及其以上的，按本人工资的95%发给。