事业编和公务员区别在于经费来源不一样：公务员是行政编制，财政全额拨款。事业编制分三种，财政全额拨款，差额拨款，自收自支。
待遇、地位不一样：这点在很多地方都有体现，在体制内的行政或事业单位中，行政编制地位最高、待遇最好，这里所说的待遇包括工资、福利、升迁机会。而稀缺程度也是依次递减，行政编制最少、最稀缺，事业编制多。这两种编制很占资源。所以国家严格限制其数量。
职能职责不同：理论上，公务员是”依法行政“的；而事业单位的全称是公益性事业单位，部分事业单位也有公共服务、行政的只能，部分其实是企业行政的，鉴于此事业编制也是这些职能。
在很多体制外的人看来，事业单位和公务员是差不多的，都是体制内拿财政工资的人，但实际上两者区别还是很大，下面简要的从几个方面来说一下区别：
单位性质不同
公务员所在的单位是机关，而事业编所在的单位是事业单位，包括参照公务员管理事业单位、全额拨款事业单位、差额拨款事业单位、自收自支事业单位。
单位职工身份不同
公务员的身份是行政编，事业单位人员的身份是事业编，在整个行政事业体制中，行政编的数量占少数部分，事业编数量庞大包括教师、医生等数量庞大的群体。
聘用形式不同
在失业保险缴纳方面，公务员不用交失业保险，事业单位员工实行合同聘用制，与所在单位签订劳动合同，缴纳失业保险，也就是说事业编与企业职工一样存在失业的风险。
工资体系不同
机关的工作人员实行基本工资+津补贴的制度，而事业单位的工作人员是事业编实行基本工资+绩效工资制，在未来改革的方向中事业的工资肯定会参照企业实行绩效考评制度，工资与个人绩效相结合，收入与付出成比例。
员工职业发展不同
公务员可以提拔晋升，实行职级过度，工作满一定年限可以享受科级待遇，而事业编只能靠职称涨工资，如果专业对口的话，评职称可能相对容易一些，如果专业与所在单位不对口的话，很难取得职称，因此很多人穷尽一生都是初级职称，与同时间参加工作的公务员会有较大的差距。
进入单位难易程度不同
目前进入机关事业单位都实行逢进必考的制度，因此都需要进行招录考试，公务员的考试一般由本省的由省委组织部统一组织，考试内容为申论与行测两门，而部分地区的事业编考试的组织部门级别会低一些，有些单位自己都可以组织招考，考试只需要考一张试卷，里面融合了申论、行测的内容，但是内容相较于公务员考试要简单些。
升迁待遇不同
2019年6月1日，新《公务员法》施行了，其中最重要的一点是职级并行，说简单点就是公务员你只要不违反纪律，工作四五年之后，虽然级别上升的可能性不大，但是你的工资待遇提高一级，享受上一级工资待遇，如果你是科员，五年以后，虽然你还是科员，但是你的工资待遇大概相当于副科级干部的。但是事业单位，你除非晋升，由科员晋升为副科，你的工资待遇才能大幅度提高，不然你一辈子就是科员的工资待遇，就是每两年根据你的工龄调工资也是增加几十块钱。
综上所述，两者之间的差别还是比较大的，如果想进入体制内工作的话，在参加考试之前一定要认真甄别报考的到底是什么单位，以免造成心里落差。
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经费来源不一样：公务员是行政编制，财政全额拨款。事业编制分三种，财政全额拨款，差额拨款，自收自支。
待遇、地位不一样：这点在很多地方都有体现，在体制内的行政或事业单位中，行政编制地位最高、待遇最好，这里所说的待遇包括工资、福利、升迁机会。而稀缺程度也是依次递减，行政编制最少、最稀缺，事业编制多。这两种编制很占资源。所以国家严格限制其数量。
职能职责不同：理论上，公务员是”依法行政“的；而事业单位的全称是公益性事业单位，部分事业单位也有公共服务、行政的只能，部分其实是企业行政的，鉴于此事业编制也是这些职能。