法律分析：被留置三个月的公务员最轻的处理为开除职务的决定。如果涉嫌利用职务便利犯罪的，检察机关在查明以后，判断该犯罪事实明确、证据充分的，则会提交相关材料和证据进行提请公诉。公务员一旦被留置，最轻处理是开除公职，有的涉嫌犯罪可能会被判刑。
法律依据：《中华人民共和国刑法》 第三百九十七条 国家机关工作人员滥用职权或者玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。本法另有规定的，依照规定。国家机关工作人员徇私舞弊，犯前款罪的，处五年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处五年以上十年以下有期徒刑。本法另有规定的，依照规定。