她长有满头的蛇发，及一对野猪的獠牙，就连脖子上都长满了蛇的鳞片，甚至下身也变成了蛇的样子，（多数是响尾蛇的下身，因为羞辱她所以连下身都变成如此自傲的响尾蛇的下身）于是智慧女神赐予了她一对任何看到她们的人都会立即被变成石头的双眼。
美杜莎本是个美貌的女子（有传言是波塞冬的孩子），一种传说是雅典娜嫉妒她的秀发，更为广泛流传的传说是波塞冬被美杜莎的美貌所吸引把她在雅典娜的神庙里给强奸了，而这激怒了雅典娜。雅典娜不能惩罚波塞冬，于是便把美杜莎变成了可怕的蛇发。
还有一说是墨杜萨是波塞顿的恋人，因为波塞顿有一次跟她到处观看他统治的海域王国时，一时间波塞顿说出了雅典娜用不正当手段夺取雅典国，本是句戏言，但被墨杜萨信以为真，事后不久，墨杜萨命自己的两个姐姐去雅典国捣乱，结果被雅典娜和月神得知，雅典娜无法忍受墨杜萨对她的蔑视和他那两个姐姐的嚣张跋扈，并毁坏她的村庄。虽知此事是其叔叔的杰作，但因为无法报复，只好把气撒在了墨杜萨身上，让叔叔找来墨杜萨后，一气之下叱责墨杜萨，指她用美貌诱人、心肠歹毒，只有丑陋的面貌才能匹配她那恶毒的心，将她变成了一个蛇发魔眼的女怪，韩国的动漫奥林匹斯星采用的就是这个版本。
蛇妖美杜莎
宙斯之子珀尔修斯知道这个秘密，因此背过脸去，用光亮的盾牌作镜子，找出美杜莎，在雅典娜和赫耳墨斯的帮助下割下了她的头。从美杜莎的躯体里跳出双翼飞马珀伽索斯和巨人克律萨俄耳，他们都是美杜莎的后代。克律萨俄耳骑着从美杜莎鲜血中飞出的珀伽索斯，在空中遇到狂风的袭击，被吹得左右摇晃，从美杜莎的头颅上滴下的鲜血落到利比亚沙漠中，成为毒蛇。美杜莎的血液虽然剧毒，却拥有特殊的力量，曾赋予埃里克特翁尼亚斯以起死回生的能力。珀尔修斯用割下的美杜莎的头颅杀死了海怪塞特斯，回去后把头颅交给雅典娜，雅典娜把它固定在自己的盾牌、胸甲中央。 美杜莎的头像常被艺术家用在象征性的徽章、建筑的装饰物甚至雅典的钱币上，也曾用于士兵的盾牌上。
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