六部九卿是指中国古代的政府机构。大约从西周开始，政府机构就有了六部的划分。这六部包括司徒、司马、司空、司寇、大行人、宗伯，这些官职由大夫担任。
到了秦汉时期，出现了“九卿”的说法。九卿是对中央各部门长官的一种尊敬的称号。秦汉时期的九卿有一个重要特点，那就是君主家事与国事不分，政治事务与宫廷事务混杂在一起。
秦汉时期的九卿包括：
1. 太常（奉常）：负责宗庙礼仪，下属有太史令负责天象历法，太医令负责医疗，博士负责经学传授。
2. 郎中令：负责宫殿门户的守卫，下属有大夫负责议论，有谒者负责引见传达。
3. 卫尉：负责宫门警卫。
4. 太仆：负责皇帝车马，兼管全国的马政。
5. 廷尉：是全国最高司法官。
6. 典客：负责接待少数民族事务。
7. 宗正：负责皇族事务。
8. 治粟内史：负责租税钱谷盐铁和国家的财政收支。
9. 少府：负责皇家钱财、皇室用品供应及各项宫廷服务事宜。
此外，还有执金吾负责京师治安，将作大匠负责宫室、宗庙、陵寝及其他土木营建，大长秋负责宣达皇后旨意与管理宫中事务。这九卿加上这三卿就是十二卿。
魏晋以后，尚书机构得到迅速发展。尚书台的总人数由秦时的七人增加到六十多人，成为中央执行政务的总机关。后来尚书各曹逐渐变为部，到隋唐时确定为六部，唐代定名为吏、户、礼、兵、刑、工，此后一直沿用到清代。六部是隋唐以后主要的政务部门。
隋唐时期的六部包括：
1. 吏部：负责全国文职官吏的任免、考课、勋封等事。
2. 户部：负责全国户口、土地、赋税、钱粮、财政收支等事。
3. 礼部：负责礼仪、祭祀、科举、学校等事。
4. 兵部：负责武官选用及军事行政。
5. 刑部：负责全国司法行政。
6. 工部：负责各项工程、工匠、屯田、水利、交通等事。
六部取代了秦汉九卿的大部分职权，九卿名称虽还存在，但内容有很大变化。例如：
1. 太常称太常寺卿。
2. 光禄勋称光禄寺卿。
3. 卫尉称卫尉寺卿。
4. 太仆称太仆寺卿。
5. 廷尉称大理寺卿。
6. 宗正称宗正寺卿。
7. 大鸿胪称鸿胪寺卿。
8. 大司农称司农寺卿。
9. 太府称太府寺卿。
到了清代，九寺只剩下五个：大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺、鸿胪寺。
北魏、北齐设置的昭玄寺，以大统、统为长官，是我国第一个掌管佛教的专门机构。
隋唐开始设五监。唐代的五监包括：
1. 国子监：主管学校教育。
2. 少府监：掌皇家钱财、皇室用品供应及各项宫廷服务事宜。
3. 将作监：掌宫室、宗庙、陵寝及其他土木营建。
4. 军器监：掌管军器制造、保管、发放。
5. 都水监：掌河渠、津梁、堤堰等事。
五监到清代只剩下国子监，而另四监都先后归并工部。在明清时新设钦天监，掌天文历法。此外，隋唐至清代还先后设立太医院、宗人府等。清代的中央行政部门可以归结为六部、五寺、二监、二院、一府，共十六个机构。
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