利用分子标记来进行基因定位的原理是什么?

Question

如题所述

Answer 1

原理：

在真核生物的基因组中，每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大，因此形成其座位的多态性，并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列。

可以根据此保守序列设计引物，利用PCR技术进行扩增，然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析。由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的。

因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带。由此可见，SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列，寻找其中的特异保护区。

RFLP的等位基因

其有共显性特点。RFLP标记位点数量不受限制，通常可检测到的基因座位数为1—4个。RFLP技术也存在一些缺陷，主要是克隆可表现基因组DNA多态性的探针较为困难；另外，实验操作较繁锁，检测周期长，成本费用也很高。自RFLP问世以来，已经在基因定位及分型、遗传连锁图谱的构建、疾病的基因诊断等研究中仍得到了广泛的应用。