人物
小说中，孙悟空为野性十足的妖仙形象，猪八戒的形象则黑瘦一些，外型类似于野猪。在电视剧中，前者是更具有舞台扮相特点的人文形象，后者体征则像肥硕白净的家猪。
在小说中，孙悟空的身高为四尺，沙悟净的身高为一丈二，而电视剧中师徒没有按照这个标准。
小说中，负责挑担的是猪八戒，而非沙悟净。沙悟净只有在对付妖魔时有较多活动描写，电视剧中增加了一定的戏份，而且重新塑造了沙悟净的形象。
小说中，沙僧面貌丑陋，十分吓人。而电视剧中沙僧则长得较像壮汉，而且并不丑陋吓人。
小说里的唐僧非常懦弱，害怕妖精，轻信人言。电视剧中对其性格进行了修饰，显得更为沉稳。
车迟国王后（赵丽蓉饰）在小说中不曾提及，但在电视剧中安排了与国王同等多的情节。
失误
原著中孙行者斥骂猪八戒为“夯货”，词音读为bèn huò，即“笨货”；“夯”为“笨”的异体字。电视剧中则错念为hāng huò ，原因是“夯”有两个读音，念hāng时表示一种砸地基用的工具，念bèn时是“笨”的异体字。
原著第四十六回中，孙行者将“山河社稷袄，乾坤地理裙”变作“破烂流丢一口钟”。据屈小强著作《西游记中的悬案》中释疑，“...一口钟”应为僧家未经缝合的钟型罩衫。电视剧初次播出的版本中该道具表现为一口微型铸钟，后剧组采纳意见重拍了这个镜头，将铸钟换为破衣。
在小说中，唐僧本人一直受到六丁六甲、五方揭谛、四值功曹、一十八位护教伽蓝轮流保护，师徒四人在途中还经常受到他们的接济以及获得情报。电视剧为了简化故事，相关情节都被删去，从而孙悟空的能力显得更为神通广大。
电视剧第18集“扫塔辨奇冤”源自小说第62回《涤垢洗心惟扫塔 缚魔归正乃修身》，但电视剧对此进行了大规模的改编。龙王之死改为被九头虫用毒药毒死（原文是被孙悟空打死），龙女则逃过一死。奔波儿灞和灞波儿奔的剧情被大量扩充，二者最后双双毙命（原文中则逃过一死）。祭赛国国王对金光寺僧众的态度也有很大不同，电视剧改为直到孙悟空拿回宝珠，国王才赦免僧众。而且电视剧还安排白龙马变回龙王三太子，亲自取回宝珠。
小说中明确说明孙悟空与猪八戒有积怨，在狮驼岭孙悟空还故意让猪八戒被妖魔抓走。电视剧中这些情节都被删除。二人的关系变得更为融洽。
“祈雨凤仙郡”和“大闹披香殿”2集对原文小说第87回《凤仙郡冒天止雨 孙大圣劝善施霖》进行了大规模改编，只保留了基本故事框架。原著中，凤仙郡郡守在第一次祈祷后，玉帝立即降雨。电视剧中，孙悟空的反抗精神再次得到体现，最后是孙悟空逼迫玉帝认错给凤仙郡降雨。这一改编与中国传统信仰中玉帝极其慈悲的形象不合。
原著中唐僧并不对西梁女国的国王有爱，而电视剧加了一段两人爱情的感人描绘，说明唐僧也是凡人，这段情节一些人认为塑造得相当成功，但被另一些人批评不合逻辑：唐僧是个高僧，断不会做此事。
小说中，孙悟空嗜杀，曾在打死尸魔（电视剧中叫“白骨精”）被师傅贬走后，回到花果山，制造风沙屠杀了上千入山狩猎的猎户。此情节在电视剧中都被删去。
原著中，孙悟空三兄弟收徒弟的故事发生在天竺国玉华州，而电视剧中则将其与灭法国的故事合在一起。
原著中，唐僧师徒接受第八十一难——在通天河落水後，曾前往陈家庄并参观了为其修建的庙宇。电视剧中则将这段故事删去。
原著中，唐僧师徒将经文送往大唐後，复转西方，纔被佛祖赐封。电视剧中，唐僧师徒还未将经文送往大唐就已被佛祖赐封。
原著中，唐僧离开长安时，带有两个徒弟，三人被妖怪捉住後，二个徒弟被妖怪所食，唐僧被太白金星所救。电视剧中，唐僧则孤身上路。
原著中，唐僧在收降八戒後曾在浮屠山从乌巢禅师处受多心经，电视剧中则删去此故事。
原著中，在车迟国斗法的故事里，鹿力大仙与悟空赌开膛破肚，羊力大仙与悟空赌下油锅洗澡，最後都死了。而电视剧中，可能受播出时间限制，故改编在虎力大仙死亡後，鹿力大仙和羊力大仙驾云逃走。
原著中详细描写了观音与木叉劝化沙僧和猪八戒的故事，电视剧中被删去。
原著中，猪八戒曾在稀柿同变成巨猪开路，电视剧中被删去。
原著中，狮驼岭故事并无孔雀公主，报信的是太白金星，电视剧中增加了孔雀公主。而且，原著中，狮驼岭的三怪一开始就在一起，电视剧中则一开始时分开的。
原著中有唐王游地府，电视剧中被删去。
电视剧在《真假美猴王》一集中增加了到龙宫辨认真假的故事。
原著《真假美猴王》中，唐僧师徒一直停留在农家直到故事结束，而电视剧中则在停留一小段后就离开。
原著《真假美猴王》中，谛听是只兽，而电视剧则变成了一个人。
电视剧在大闹天宫中，增加了孙悟空撑破托塔李天王宝塔（但并未说明日后宝塔如何恢复原状）、玉皇大帝爬到桌子底下等情节。删去了雷将与孙悟空的打斗，也删去了玉帝派人请如来佛祖的情节（电视剧中只有一句话，原著中则详细描写了如何请佛祖）。
原著中，花果山上的仙石，先迸裂出石卵，石卵再因风化为石猴。而电视剧中则是石头爆炸，孙悟空就跳了出来。
电视剧中，本该出现魏征梦斩泾河龙故事的地方（唐王游地府前）没有出现此故事，但在续集黑水河故事中，又插入泾河龙王的故事。
原著中，孙悟空的虎皮裙是自己缝的，而在电视剧中，则是唐僧帮悟空缝虎皮裙。这个改编原本是为了表现唐僧对徒弟的爱，但却被人指出不合逻辑，因为唐僧是高僧，断不会做出这种杀生之事。
原著中，唐僧用手揭下了佛祖封印在五行山上的金帖，而电视剧中则是唐僧跪拜之后，金帖自行飞去。
《灭法国》中，原著唐僧四人躲在一个大黑衣柜里，夜里被强盗劫走，后被皇宫侍卫拦下。而电视剧中，四人分别躲在四个不同的地方（柜子、缸、草席等），在戏耍了三个王子后，被抬入宫中。
原著中，《弼马温》一节，增加了孙悟空与天蓬元帅打斗的故事。
唐僧被树精掳去，与树精赋诗，被树精逼婚，悟空等赶到。小说中悟空等将树精连根铲除，而电视剧第十九集改为悟空放过了树精，只是给予警告。
误入盤丝洞一段，小说中，最後毗蓝婆菩萨收走了蜈蚣精，而七个蜘蛛精都被悟空杀死，电视剧改为蜈蚣精被杀，七个蜘蛛精被毗蓝婆菩萨收走。
《偷吃人参果》一集，电视剧中，孙悟空为了救活被他推倒的镇元大仙的人参果树，曾去找传授其本事的受业师傅菩提老祖，老祖不见悟空，只能听到老祖的声音叫悟空离去。悟空含泪而去。这时老祖的声音又把悟空唤回，指点悟空去寻求南海观音的帮助，悟空大喜而去。这段情节是电视剧增加，原书没有。
艾叶花皮豹子精一集：原著中，妖怪丢出的第二个人头是先前妖怪吃剩的真正的人头，孙悟空没有发现真相，最后才知道师父没有死。电视剧中，改成第二个人头是石头变的，被孙悟空一眼看穿（但是等妖精走了才说）。
收服猪八戒一集中，原著中是孙悟空变的高翠兰与猪八戒调情，电视剧则变成了猪八戒背媳妇。
《三调芭蕉扇》中，原文是最后猪八戒打死了玉面狐狸，而电视剧中变成孙悟空偷走了碧水金睛兽之后土地神带着沙僧打死。
原著孙悟空打败了混世魔王，而电视剧中孙悟空与混世魔王结为兄弟
电视剧中少了金角大王与银角大王的七星剑和芭蕉扇
在孙悟空与巨灵神一战中，巨灵神被描写成傻里傻气地被悟空戏弄，而原著中则是真正的对打。