溶菌酶可以作为一种极具杀菌作用的天然抗感染物质。有抗菌、抗病毒、止血、消肿止痛及加快组织恢复功能等作用。临床用于慢性鼻炎、急慢性咽喉炎、口腔溃疡、水痘、带状疱疹和扁平疣等，也可与抗菌药物合用治疗各种细菌和病毒感染。口服，3～5片/次(肠溶片含10mg)，3次/日。口含，1片/次（口含片含20mg），4～6次/日。外用：以1%～2%溶液滴注、涂擦或直接喷粉。肌注：50mg～100mg/次，1～2次/日。滴眼：用2%溶液。有些人群会对其有过敏反应，它有浓痰分散、出血抑制、组织修复、消炎镇痛、抗过滤性病毒等作用，因而用氯化溶菌酶的制药有消炎消痔、治感冒、皮肤病及眼、鼻、喉等用药。