肽链由多个氨基酸借肽键线性连接而成。两个氨基酸脱水缩合形成肽键（-NH-CO-）相连为二肽，三个氨基酸就是三肽，当然还有四肽、五肽……10个以下氨基酸组成的称寡肽（小分子肽），超过十个就是多肽了，而不管几肽，都被称为一条肽链。那么，一条肽键中的肽键数=生成此肽链所脱去水分子数=生成此肽链氨基酸数-1。由于肽链是氨基酸脱水缩合形成的，所以两端必有一个氨基和一个羧基，所以一条肽链至少含有一个氨基和一个羧基（R基上可能还有）。肽链不一定是直线的，就和化学中的烷烃等链烃一样，由于化学键之间有角度，所以很难是直线的。
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