这个，要看你们公司的制度了，一般情况下：事假工资，这些都算进去要扣的，而加班工资，有些企业，只按照
基本工资为基数，来算加班工资。
关于这算的依据：加班工资基数，法律有规定，是劳动双方协商的，一般情况下，公司为了控制成本，为了控制不必要的加班，都会按照“基本工资”或者当地
最低工资作为基数。
而事假工资，如果那天你没来上班，通讯费、交通补助、职务补贴，不给，还是能说的过去的，因为那天你没来上班，也没为公司做事；生活补贴、餐补、房补等等，看
公司制度怎么规定吧，总之，怎么规定，大家都能有看法，看你自己怎么想了。