因为自然保护区是国家严格意义上进行科学研究和保护生态资源保护的地方，如果常人贸然进入就会对生态造成影响，甚至遇见危害当事人生命健康的事件。自然保护区和风景名胜区不同，风景名胜区是专门提供给游客观光，通过开发自然风光资源方式获得经济收入。而自然保护区是以保护生态环境和自然资源为主要目的，如果可以随便允许人类活动，那保护的意义何在。不仅仅是九寨沟自然保护区，而且还有其他法律规定的自然保护区，都是未经允许不可进入的。
以九寨沟自然保护区为例。九寨沟自然保护区处于高原向山地到盆地的过渡地带，地形起伏大，自然保护区内森林的覆盖率已经超过百分之八十。出于对自然资源的保护，保护区内尽量都不会采取任何的开发措施，比如砍伐树木，改变地形以建造方便通行的道路。主要在专业仪器的指引下，并且经过专业的野外生存训练，才能够在茂密的森林中找到方向。那对于普通人而言，贸然进入必定就是迷路。当遇到危险求救时，因为环境因素又会提高救援的困难，因此要求未经允许不得进入自然保护区是有道理的。
九寨沟自然保护区的建立还有出于保护自然资源的目的，其中包括动物资源。自然保护区中都有国家保护的珍稀动物，比如大熊猫和金丝猴等，还有接近八十种的受国家保护的珍稀植物。如果普通人随意进入自然保护区，不排除有些人会出于经济目的对宝贵的资源进行伤害，盗取进入市场销售以谋取经济利益，这完全违背了国家设立自然保护区的目的。与此同时，自然保护区中多为野生动物，并非动物园中受人工驯养的动物。野生动物攻击性更高，并非常人可以轻易应对。未经允许进入自然保护区，这无疑是拿自己的生命冒险。
九寨沟自然保护区以高原湿润气候为主，再加上茂密的深林，昼夜温差极大，还会出现暴雨等瞬息变化的天气。野生环境下，是非常不适合普通人活动的。加之九寨沟的地理形势非常复杂，还曾经出现过震幅较强的地震，有一定的危险性。