学校设有金山校区、新华校区两个教学园区，总占地面积123.19万平方米，总建筑面积31.90万平方米。其中，教学行政用房面积18.64万平方米。教学科研仪器设备总值10128.10万元，学校图书馆各类图书文献76.8万册（种）。
学校设有蒙医学、病理学与病理生理学、影像医学与核医学、外科
校园风采(14张)学、眼科学5个自治区重点学科，组织胚胎与人体解剖学、内科学（血液）2个自治区重点培育学科，有内蒙古自治区中蒙药实验室、分子生物学研究中心、分子病理学实验室、蒙药实验室4个自治区重点实验室，有生物医学综合实验教学中心、形态学实验教学中心、药学基础实验教学中心、中蒙医临床模拟教学实验中心、护理学实验中心5个自治区实验教学示范中心。内蒙古自治区蒙医药研究院、内蒙古蒙医药博物馆、内蒙古自治区卫生政策研究所、自治区心血管研究所、自治区骨科研究所、GLP实验室设在该校。学校紧密依托内蒙古医学院蒙医药学院和药学院的教学资源支撑、内蒙古国际蒙医院的医疗资源支撑、内蒙古蒙医药博物馆的馆藏文献资源支撑、内蒙古医学院蒙药研究所和GLP实验室的科技创新平台支撑，全力打造蒙医药学科与专业特色，已经具备了独特的优势，形成了坚强的合力。2008年，学校被内蒙古自治区政府确定为自治区博士学位授权立项建设单位鐧惧害鍦板浘
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