咸鸭蛋的保存方法很重要，不仅影响着口感，也影响着食品安全。如果放在冰箱里，可以放上60天左右，但不要冷冻，因为冻过的鸭蛋很不好吃。熟的咸鸭蛋保存的关键在于存放的温度，如果在煮好后未受到污染，可以趁热装入保鲜袋并密封。在摄氏10度以下可以放20天左右，在20度以下可以放10天左右，在温度接近30度时只能放5天左右，不需要重煮。具体来说：
1、夏天热的时候，可以放进冰箱冷藏室里存放，放在冰箱上层冷藏室就行了。
2、冬天冷的时候，可以把熟鸭蛋放在干燥通风的地方，不要放在太阳暴晒处，选择阴凉的地方最好，比如厨房储藏柜顶部、楼梯下面等等。
3、用盐水腌制的咸蛋，在煮熟前不宜长期浸泡在腌制罐里，把生咸蛋拿出煮熟并晾干后可以再放回到盐水里，这样既能保证熟咸蛋长时间放置不变质，也不会让鸭蛋越放越咸。
4、包泥腌制的咸蛋，应保持泥皮湿润，可定期用湿布给鸭蛋保湿，并置于阴凉处，这样能保证鸭蛋半年不坏。
5、可以把熟鸭蛋做真空处理，能保证鸭蛋放比较长的时间。这需要专门的仪器，如果鸭蛋比较多可去附近加工厂做真空处理。