高校专项被退档肯定会影响本科一批的录取，因为两者同时进行录取，则专项退档时本科一批同时也结束录取了
高校专项计划，是国家为更好地促进教育公平、让更多的农村学生上大学而出台的一项优惠政策，主要招收边远、贫困、民族等地区县(含县级市)以下高中勤奋好学、成绩优良的农村学生，具体实施区域由有关省(区、市)确定。
高校专项计划与地方专项计划、国家专项计划隶属于高考三大计划。
报考流程
4月25日前：有关高校公布招生简章，考生完成报名申请
5月20日前：省市完成考生基本条件审核并公示通过审核名单
5月底前：高校完成考生其他条件审核并公示通过审核名单
6月7日-8日：考生参加全国统一高考
高考后-出分前：部分试点高校组织考核
高考出分前：高校确定并公示资格名单
高考出分后：考生单独填报志愿，高校完成录取并公示
高校专项计划由教育部直属高校和其他自主招生试点高校承担，招生计划不少于学校本科招生规模的2%。中央部门高校要将调减的特殊类型招生名额优先安排高校专项计划。高校专项计划主要招收边远、贫困、民族等地区县(含县级市)以下高中勤奋好学、成绩优良的农村学生。
具体实施区域由有关省（区、市）确定。考生及其父母或法定监护人户籍地须在实施区域农村，考生本人具有当地连续3年及以上户籍和当地高中连续3年学籍并实际就读。
报考条件
(1)符合本年统一高考报名条件
(2)本人具有实施区域当地连续3年以上户籍，其父亲或母亲或法定监护人具有当地户籍
(3)本人具有户籍所在县高中连续3年学籍并实际就读