下面是工藤新一出现的时候
001 云霄飞车杀人事件（还没变小）
002 董事长千金绑架事件 （兰的回忆&.远影）
007 每月一件礼物威胁事件 (远影)
010 足球选手恐吓事件 (照片、想像&.投影)
018 六月新娘杀人事件 （回忆)
026 爱犬约翰杀人事件 (回忆）
032 咖啡店杀人事件 (回忆）
042 卡拉OK厅杀人事件 (远影）
048 外交官杀人事件(前篇 (回忆）
049 外交官杀人事件(后篇) （喝白干变大)
057 福尔摩斯迷杀人事件(前编) (回忆)
076 柯南对怪盗基德 (远影)
084 滑雪别墅杀人事件(前篇) (回忆）
096 走投无路的名侦探 连续两大杀人事件 (照片＆.想像)
100 初恋情人回忆事件(前篇) (回忆)
101 初恋情人回忆事件(后篇) (回忆）
118 浪花连续杀人事件 (平次的梦－－工藤被袭击)
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件 (远影)
162 飞天密室！工藤新一最初事件（兰回忆的~）
190 危命的复活～第三种选择(平次扮的,其实新一也在哦~)
191 危命的复活～黑衣骑士 (变回来的)
192 危命的复活～新一回来了(药效没过...)
193 危命的复活～约定的场所(药效没过,但结尾就过了...)
219 名侦探大集合 工藤新一vs怪盗基德 (回忆)
239 大阪的3个K事件(后篇) (远影)
250 偶像们的秘密(后篇) (星野辉美手中的剪报)
255 松江玉造连句十四次胜负(前编) (出现原因不明新一看见小狗走神）
271《急忙掩饰的忽略 前篇》(小兰上课走神，想起了赤井秀一和新一）
278 英语教师VS西部名侦探(后编) （照片）
280 迷宫的阴暗（后篇）（柯南回忆足球明星比护来学校找他加入球队）
285 中华街雨中的似曾相识(后篇) (兰的错觉)
286 工藤新一NY事件(事件篇) (回忆）
287 工藤新一NY事件(推理篇) (回忆）
288 工藤新一NY事件(解决篇) (回忆）
300 友情与杀意的关门海峡(后篇) (回忆）
304 震动的警视厅 1200万人质 (兰的错觉＆.远影）
312 染上夕阳的布偶（前篇）(回忆)
330 被挑拨的友情（后篇）(回忆)
331 疑惑的咖喱饭（上篇）(想像)
343 便利店中的阴谋(前篇)(回忆&.远影)
344 便利店中的阴谋(后篇) (错觉、照片&.远影)
345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件（假扮&.回忆）
383 来自甲子园的恶魔的挑战（兰的回忆）
387 斯特拉蒂瓦里的不谐和音（尾曲）（柯南回忆自己唱歌－－恐怖啊）
400 心存疑惑的兰(回忆&.远影）
410 同时进行的舞台剧和绑架案(后篇)（回忆）
411 神社牌楼的惊人暗号
412 神社鸟居之惊悚暗号(远影）
422 银杏色的初恋(后篇)（回忆）
413 完全一半犯罪之谜 （柯南的回忆）
437上户彩和新一 四年前的约定（回忆）
472 少年工藤新一的冒险（前篇）
473少年工藤新一的冒险 （后篇）
490工藤新一vs服部平次 滑雪场的推理对决（中学时候，推理部分最好看）
521 杀人犯、工藤新一(以其身份登场的是个整容的犯人,真人开始是柯南,之后化妆成死罗神)
522 新一的真实身份和兰的眼泪
523 真正想问的事
524 憎恶的蓝色火花(前篇) （开头一些提到了）
545 雾中尖叫的魔女(前篇)（远影）
557 与危险的二人同行(柯南和哀打电话时出现了一下）
565 没有看见的目击者（开头提到 想象）
573 于心有愧的护身符的去向(前篇) （小兰回忆522集的情形．．．．）
592猴子和竹靶的酉之大祭(前篇) （小兰回忆523集的情形...）
616 福尔摩斯的启示录（名侦探的弟子）（变回来的）
617 福尔摩斯的启示录（Love is 0）（变回来的）
618 福尔摩斯的启示录（撒旦）（变回来的）
621 福尔摩斯的启示录（0 is start）（兰的回忆）必看的哦！新一在大本钟下向兰告白啊！挺浪漫的，呵呵！
622 紧急事态252（前篇）
特辑：
飞上天空的十颗行星
ova：
01－柯南vs基德vs铁剑
02—十六个嫌疑犯（兰的回忆）
08—女子高中生侦探---铃木园子的事件簿（兰的想象）
09（M12特典）—工藤新一 迷之墙和黑色拉布犬事件
剧场版：
1997 引爆摩天楼 （远影）
1998 第十四个目标 （远影&.回忆）
1999 世纪末的魔术师 （错觉&.假扮）
2000 瞳孔中的暗杀者 （照片、远影&.回忆）
2001 通往天国的倒数计时 （远影）
2002 贝克街的亡灵 （兰的回忆）
2003 迷宫的十字路 （回忆&.变回来的&.远影）
2004 银翼之魔术师 （假扮&.远影）
2005 水平线上的阴谋 （回忆&.远影）
2006 侦探们的镇魂歌 （回忆&.远影）
2007 绀碧之棺 （兰的回忆）
2008 战栗的乐谱 （兰的回忆)
2009 漆黑的追踪者 （吃了药，变大)
有希子
TV版（其中带★的为特别篇） 043 江户川柯南诱拐事件 艾琳·艾德勒在剧场版中的有希子形象
（本集中化妆成一位胖女人，称是柯南的妈妈，化名“江户川文代”） 096 走投无路的名侦探 连续两大杀人事件★ （在新一的身份就快为兰识破时 及时出现并解了围） 100 初恋情人回忆事件(前篇) (远影） 144 上野出发北斗星3号（前篇）（其中化名为明智文代） 145 上野出发北斗星3号（后篇）（同上） 193 危命的复活 约定的场所 (回忆中年轻时优作向有希子求婚的场景中出现 本集约定的场所是二人定情的地方） 286 工藤新一NY事件（事件篇） 287 工藤新一NY事件（推理篇） 288 工藤新一NY事件（解决篇） 333 相似的公主（前篇） 334 相似的公主（后篇） 335 东都显影所的秘密（前篇） 341 厕所里隐藏的秘密（后篇） （哀提到柯南的妈妈） 345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件★ 346 寻找屁股上的印记(前篇) （提到帮柯南易容成哀检测上学路上没有跟踪的人 没有正面出现） 387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音（后奏曲）（柯南回忆小时候 妈妈弹琴） 418 米花町阁楼的房屋（易容成老太婆） 472 工藤新一少年时的冒险（前篇） 473 工藤新一少年时的冒险（后篇） 490 工藤新一VS服部平次滑雪场的推理对决!★ 剧场版 第6部 贝克街的亡灵（在游戏中被设计成扮演福尔摩斯最欣赏的女人艾琳·艾德勒 最后为柯南一行所救） 青山刚昌短篇集 1：彷徨的红蝴蝶 （有希子的谜题） 2：飞上天空的十颗行星 （第一次 工藤一家齐登场 那时的新一还很小很可爱 但已经会破案了） 剧场版特典 M12特典 工藤新一 迷之墙和黑色拉布犬事件参考资料：
http://baike.baidu.com/view/33799.html?wtp=tt#5 妃英里
TV：
032 咖啡店杀人事件
096 走头无路的名侦探！连续两大杀人事件★
114 有氧潜水杀人事件（前篇）
115 有氧潜水杀人事件（后篇）
171 黑暗之中的死角（下集）
199 嫌疑犯毛利小五郎（前篇）
200 嫌疑犯毛利小五郎（后篇）
264 法庭的对决 妃VS小五郎（前篇）
265 法庭的对决 妃VS小五郎（后篇）
297 法庭的对决2 妃VS九条（前篇）
298 法庭的对决2 妃VS九条（后篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
333 相似的女王陛下（前篇）
334 相似的女王陛下（后篇）
431 本厅刑事恋爱物语7（前编）
438 鱼邮件的追踪
445 俄罗斯蓝猫的秘密
472 工藤新一少年时的冒险（前篇）
473 工藤新一少年时的冒险（后篇）
474 妃英理律师之恋
489 法庭的对决3 目击者是检察官★
505 律师妃英理的证词（前篇）
506 律师妃英理的证词（后篇）
剧场版：
M2：第十四个目标
M4：瞳孔中的暗杀者
M8：银翼的奇术师
M10：侦探们的镇魂歌
OVA：
OVA2:16个嫌疑犯