你这个语法问题看似简单实则复杂，是
英语语法中的一个难点，很多研究生都常常分不清楚，我尽量给你讲清楚些。
你这个是表语从句。
主语从句和表语从句这两个确实很难分清，因为他们的连接动词是一样的，都是be或者
系动词。你上面说表语从句的连接动词除了be还有系动词，其实主语从句的连接词除了be也可以是系动词的。比如这句：When he was killed remained unknown. 这个句子是主语从句但连接词就是系动词。所以区分主语从句还是表语从句并不是看连接动词什么动词，而是看从句在复合句中所担当的成分。
具体说你这个句子：
你这个句子就是典型的表语从句：It（主语） appears（系动词） that she was wrong（从句担当表语成分），这个是典型的
主系表结构。
但如果我变一下你这个例句.：It appears certain that she was wrong.我在连接动词后加了个certain，这个就是主语从句了。这个句子的真正语序是：That she was wrong appears certain.看到了吧，从句在复合句中担当的成分是主语而不是表语。
所以，以后看到it开头的句子，千万不要就主观的认为它一定是主语从句还是表语从句，也不要根据连接动词是不是系动词去判断，这些都不是我们判断的标准，真正的判断的标准就是对句子结构进行分析，从而分清从句在复合句中所担当成分。
至于为什么要用it作形式主语，是因为在实际讲话中，为了避免头重脚轻即前面的主语因为是从句而显得主语太长，经常用it作为形式主语放在句首，而把真正的主语放到句尾。因为欧美人的讲话习惯是先从最简单的词和句子开始说，把长的放到后面。
我知道你为什么会搞混了，.It appears that she was wrong.这个句子是个系表结构，从句在复合句中担任表语成分，真正的主语就是it。而It appears certain that she was wrong.这个句子也是个主系表结构，但真正的主语不是it而是后面的从句。所以，我可以告诉你我的小诀窍，以后分不清的时候，你就看连接动词后面有没有东西，如果没有就是表语从句，如果有东西一般就是主语从句，比如我例句中用的certain。另外我所指的这个“东西”一般都是形容词。但如果不是形容词而是其他成分就不一定是主语从句了，比如是名词或者
不定式、介词短语等等，所以还必须具体句子具体分析。举例：It appears the truth that she was wrong. 乍一看，这个句子很像主系表结构，再仔细一看，appear还有面有个东西“truth”然后才出现的从句，那这个句子就是主语从句吗？我们把它还原到真正的语序为The truth that she was wrong appears certain.这个句子里主语是truth，从句that she was wrong是主语truth的同位语，appear系动词，certain作表语。所以这个句子并不是主语从句，而是一个主系表结构，而且主语还嵌套一个
同位语从句。
应该解释得很清楚了，看我打了这么多字，再加点分好不？