山东民办二本学校排名前三的是齐鲁医药学院、青岛农业大学海都学院、山东财经大学东方学院。
1、齐鲁医药学院
齐鲁医药学院位于山东省淄博市，是经教育部批准成立的全日制普通本科高校，为山东省民办本科高等教育特色名校立项建设单位。学校总占地面积2052亩，总建筑面积62万平方米，固定资产13.58亿元，教学、科研设备总值2.08亿元，馆藏纸质图书200.72万册。
2、青岛农业大学海都学院
青岛农业大学海都学院是一所全日制普通本科学校。学院坐落于胶东半岛莱阳市和莱西市，设在青岛农业大学海都学院莱西校区和青岛农业大学莱阳校区。学校占地约1000亩，图书馆藏书66.81万余册，固定资产总值17766.8万余元，教学仪器设备值4036.09万余元。
3、山东财经大学东方学院
山东财经大学东方学院位于山东省泰安市，由山东财经大学和山东黄金集团有限公司按新机制、新模式联合举办，经国家教育部批准的全日制独立学院。学校占地面积530余亩，建筑面积15.4万平方米。设有8个二级学院、28个本科专业及专业方向。有全日制在校生8500余人。
民办二本的性质和特点：
1、办学资金来源：民办二本通常是由民营企业或个人投资创办的，其办学经费主要来自学费、科研经费等非政府资金。与公办二本相比，其办学资金来源更为广泛。
2、师资力量：民办二本的师资力量通常比较薄弱，教师的整体水平和公办二本相比可能存在一定的差距。但也有一些民办二本会聘请一些知名教授或专家作为学校的师资力量补充。
3、学科设置：民办二本通常会根据市场需求和学校实际情况设置学科，与公办二本相比，其学科设置可能更加灵活。但也有一些民办二本会模仿公办二本的专业设置，导致学科设置雷同。
4、教学质量：民办二本的教学质量与公办二本相比可能存在一定的差距。但也有一些民办二本注重教学质量和教学水平的提高，通过加强师资力量、完善教学设施等方式提高教学质量。