法律分析：公司不可以扣发员工的年终奖。劳动者可以通过以下方法维权：与公司协商；向劳动行政部门投诉；向调解组织申请调解；向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服，向人民法院提起诉讼，或者直接向人民法院请求支付令。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《劳动争议调解仲裁法》 第五条 发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。