正当少年R要独自出村，博士把他叫住了，并告知草丛里栖息着着野生的精灵，除非上边带着自己的精灵，不然会很危险……然后将少年带到了他的研究所。
故事就这么拉开了序幕，玩家所扮演的角色就是名叫R的少年(当然你也可以自己取名字),住在真新镇（マサラ）。随着博士到达研究所，同时遇上了博士的孙子，名字叫小茂的少年(当然也可以自己取名字，就起你的仇人的名字吧)。博士让你在他所拥有的三只精灵中任选一只相赠（三只精灵分别为：小火龙、杰尼龟、和妙蛙种子，均能有两次进化），选个你喜欢的吧。挑好后，小茂也选了一只（在属性上克你的），并向我提出挑战。作为开盘战，不是很难，就当先试试战斗系统吧。而后他离开，但这只是开场白，以后他有的烦你了。
辞别了博士，可以离镇了。果然如博士所言，草丛里确实藏有不少精灵，好好练一下级吧。很快便来到了常磐市（トキヮ），在商店里，从店主手里得到邮件。连忙赶回研究所将它交给博士，博士就会给你图鉴，于是菜单中多出一项图鉴，这意味着可以开始着手收集精灵的工作了。顺便再去一趟邻居小茂的家，拿到小镇地图（注意：此时不拿的话，以后就再不能拿了），可以正式出发了。
追问可以不收集精灵吗？ 求全精灵技能表
追答图鉴和地图不收集精灵也给你呀
全精灵图鉴（有技能表）
http://zhidao.baidu.com/question/108077270.html?an=0&si=8
参考资料：http://zhidao.baidu.com/question/136224323.html?si=6
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