单位开除员工的程序： 1、通知劳动者 解除劳动合同 ； 2、将解除劳动合同理由通知工会； 3、出具 解除劳动合同证明 ； 4、办理档案和社会保险关系转移手续； 5、办理工作交接，支付经济补偿。 《 劳动合同法 》第五十条规定，用人单位应当在 解除或者终止劳动合同 时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。 劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。 用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。
单位以职工违反劳动纪律等理由解除劳动合同，要达到一定程度才可以，或者是双方劳动合同约定的，或者是单位规章制度明确规定的。开除是解除被处分人与行政机关人事关系的纪律制裁方式，也是最为严厉的制裁方式。被开除后，被处分人不再具有行政机关公务员的身份。受到开除处分的职工对处分不服，与企业发生争议，就称为开除争议。在判断现实生活中的劳动争议是否属于开除争议时，应主要看企业最终处理结果，而不是看其处理的原因。用人单位开除职工的原因、依据多种多样，有的因职工违反纪律，有的是因职工破坏了企业规章(包括分房规定、计划生育规定等)，有的是依据《企业职工奖惩条例》，有的是依据《国家行政机关工作人员奖惩暂行规定》，也有的是依据企业规章。无论用人单位以何种理由、何种依据，也无论理由、依据正确与否，只要是对职工实施了开除处分，就涉及职工最大的劳动权利，职工对开除处分不服而发生争议，就属于开除争议。按照《企业劳动争议处理条例》规定，只要争议当事人提出申诉，劳动争议处理机构就应当受理，而不应以开除的原因、依据不当或受理后很难处理作为不予受理的理由。处理开除争议主要适用的法律规范性文件有《企业职工奖惩暂行条例》、《国家行政机关工作人员奖惩暂行规定》、《全民所有制工业企业转换经营机制条例》、《关于〈企业职工奖惩条例〉若干问题的解答意见》等等。此外，企业依法制定的企业规章也可作处理依据。