具体操作方法如下：
1、专用发票已交付购买方的，购买方可在增值税发票系统中填开并上传《开具红字增值税专用发票信息表》或《开具红字货物运输业增值税专用发票信息表》（以下统称《信息表》）。《信息表》所对应的蓝字专用发票应经税务机关认证。
经认证结果为“认证相符”并且已经抵扣增值税进项税额的，购买方在填开《信息表》时不填写相对应的蓝字专用发票信息，应暂依《信息表》所列增值税税额从当期进项税额中转出，未抵扣增值税进项税额的可列入当期进项税额，待取得销售方开具的红字专用发票后，与《信息表》一并作为记账凭证。
经认证结果为“无法认证”、“纳税人识别号认证不符”、“专用发票代码、号码认证不符”，以及所购货物或服务不属于增值税扣税项目范围的，购买方不列入进项税额，不作进项税额转出，填开《信息表》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。
专用发票尚未交付购买方或者购买方拒收的，销售方应于专用发票认证期限内在增值税发票系统升级版中填开并上传《信息表》。
2、主管税务机关通过网络接收纳税人上传的《信息表》，系统自动校验通过后，生成带有“红字发票信息表编号”的《信息表》，并将信息同步至纳税人端系统中。
3、销售方凭税务机关系统校验通过的《信息表》开具红字专用发票，在增值税发票系统中以销项负数开具。红字专用发票应与《信息表》一一对应。纳税人也可凭《信息表》电子信息或纸质资料到税务机关对《信息表》内容进行系统校验。
扩展资料：
纳税人在增值税发票系统升级版中开具红字发票方法：
纳税人可在增值税发票系统中填开、上传《信息表》。税务机关通过网络接收纳税人上传的《信息表》系统自动校验通过后，出具带有“红字发票信息表编号”的《信息表》，并通过网络将信息同步至纳税人端系统中。纳税人凭税务机关系统校验通过的《信息表》开具红字专用发票，在增值税发票系统中以销项负数开具。
一、安装登录问题（8个）
1.如何安装开票软件？
答：依次按照下面流程操作：
（1）将初始发行成功的金税盘连接到电脑上，无需安装金税盘驱动。
（2）双击安装文件夹中的kp-setup.exe安装程序图标，默认“完全安装”，然后按照提示逐步完成即可。
2.如何完全卸载开票软件？
答：在电脑的“开始”—“程序”—“开票软件”下，点击“卸载”，即可完全卸载开票软件（包括数据库、注册表等）。
3. 开票软件需要安装在可以上网的计算机上吗？
答：需要开通互联网，互联网用于开票软件向税务局上传开具的发票数据、更新商品与税务服务分类编码等。若因故不能使用互联网，纳税人需要跟税务局说明情况。
4.可以在哪些操作系统上安装开票软件？
答：可以在winXP sp3、vista、win7、win8、win8.1操作系统（可以是32位或者64位）上安装开票软件。
5.双击“开票软件”图标后，出现下图提示，如何解决？
答：电脑上未插金税盘，或者电脑的USB接口损坏，请重新将金税盘插到计算机其他的USB接口上。
6.开票软件安装成功后，360杀毒软件弹出下图提示，如何解决？
答：首先请在安装开票软件前，更新360病毒库，如果仍提示上图所示，请将开票软件加入白名单或选择信任。
7.开票软件安装成功后，双击“开票软件”图标没有反应，或者在开票软件使用过程中突然退出，如何解决？
答：此现象是由于计算机使用的360杀毒软件或者电脑管家没有及时更新病毒库引起的，请更新杀毒软件的病毒库，然后卸载开票软件后再重新安装。
8.开票软件必须要安装在C盘吗？
答：企业可以自己选择安装在任意盘符下，建议不要安装在系统盘下。
二、系统维护问题（9个）
1.首次登录开票软件，如何进行系统初始化？
答：依次按照下面流程操作：
（1）设置实际主管姓名和密码。
（2）填写营业地址、电话号码和开户行及账号。
（3）设置安全接入服务器地址，测试成功即可完成初始化。
2.开票员和管理员可以设置成同一个人吗？
答：不可以，开票员和管理员的名字不能相同。
3.如何增加开票员？
答：以管理员身份登录开票软件，点击主界面的“用户管理”菜单项，弹出“用户管理”窗口，点击即“新增用户”按钮，在弹出的“新增用户”窗口中输入“用户名称”和“密码”，“隶属角色”选择“开票员”确定即可。
4.如何修改管理员的登录密码？
答：以管理员身份登录开票软件，点击主界面的“用户管理”菜单项，弹出“用户管理”窗口，点击即“修改密码”按钮，在弹出的“修改用户密码”窗口中输入原密码和新密码点击“修改”即完成密码的修改与保存。
5.如何修改开票员的用户名和密码？
答：以开票员身份登录开票软件，点击“系统维护/用户名密码修改”菜单项，在弹出的界面中输入原密码后，原密码正确后激活新用户和密码录入项，录入完成后点击“修改”即完成用户名和密码的修改与保存。
6.地址电话和开户行及账号在税务局做了变更，回来后进入开票软件，发现信息还是原来的，如何处理？
答：地址电话和开户行及账号在税务局变更后，需要登录开票软件进行手工修改，点击“系统设置/系统参数设置/基本参数设置”进行修改。
7.如何设置备份目录？
答：以管理员或者开票员身份登录开票软件，点击“系统维护/数据备份设置”菜单项，在弹出的“数据备份选项设置”中点击“浏览”按钮，设置数据备份文件保存路径，完成后点击“确定”即可。建议将备份目录设置在非系统盘符中。
8.如何进行数据备份？
答：以管理员或者开票员身份登录开票软件，选择“系统管理”菜单项，点击主界面的“数据备份”即可对数据进行备份。
9.如何进行数据恢复？
答：以管理员身份登录开票软件，点击“系统维护/数据恢复工具”菜单项，双击一条要恢复的记录，点击“是”按钮执行数据恢复。本回答被提问者采纳