城都3主角（小锔鳄、菊草叶、火球鼠）：游戏初期获得（你问的应该不是这个）
关东3主角（杰尼龟、妙蛙种子、小火龙）：通关后完成关东地区剧情，即取得关东地区全部徽章，从大木博士处得到技能机器攀岩，到白银山挑战小智，胜利后再去找大木博士，就可以从三主角中选一只
芳缘3主角（水跃鱼、木守宫、火稚鸡）：同样是击败小智后，到关东地区金黄市（超能力道馆那个城市）的希鲁夫大厦，在一层可以见到芳缘联盟冠军大悟（红、蓝宝石最终BOSS），他会问你喜欢红、绿、蓝哪种颜色，每个颜色对应一只主角（红-火，绿-草-，蓝-水），回答后得到
但要注意触发这些剧情时身上携带的精灵要有空位
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