为了规范农业综合开发的财务行为，提升资金使用效率和管理水平，依据财政体制和财务会计制度的规定，以及财政部第29号令和相关财务规则，我们制定以下财务管理办法。
第一条，本法规适用于农业综合开发的管理部门和建设单位的日常财务活动，但不包括外资项目的财务管理在内。
第二条，财务管理的核心原则是依据资金投入来控制项目的规模，对资金实施项目化的管理；实行专人负责、独立账簿记录、专款专用的制度。同时，县级层面的财政无偿资金需要实行报账制。
第三条，农业综合开发的财务管理目标明确，即严格执行国家的法规和政策，建立完善的财务管理制度。其主要任务包括：科学编制年度财务计划，依法筹集和使用资金，确保专款专用；强化会计核算、预算管理以及资产管理工作，定期提供财务报告，并加强财务监督。
最后，各级管理部门和建设单位必须设立专门的财务管理部门，配备具备会计从业资格的专业人员，以确保农业综合开发资金的高效和规范管理。
《农业综合开发财务管理办法》于2006年7月27日由财政部以财发〔2006〕39号印发。该《办法》分总则、财务计划管理、资金筹集、资金使用和支出管理、工程成本管理、资产管理、负债管理、净资产管理、财务监督、财务报告和财务分析、附则11章63条，自发布之日起执行。原《农业综合开发财务管理办法》（财发〔2000〕57号）同时废止。