会现场发生山崎总经理被害事件。解决这个事件的是以福尔摩斯式的推理能力而声名大噪的高中生侦探——工藤新一。在和青梅竹马的毛利兰一起去游乐园玩、乘坐云霄飞车时一名男子惨遭杀害……
第2集 董事长千金绑架事件
在现场目击黑衣男子犯罪的新一遭袭击昏迷，并被强灌不知名的药。醒来时竟变成一个小孩！于是暂时住到了女友兰的家里、这时小五郎接到了诱拐事件的委托…
第187集 黑暗中的神枪响
小五郎接受古川悦子的委托保护它的母亲。然后在古川家等待悦子回来的时候知道了家属和女佣之间发生了很多金钱上的纠纷。悦子回来后去母亲的房间叫母亲时从母亲的房间传来了枪声。
第188集 生死一瞬间-侦探队洞窟探险记
和阿笠博士去露营的少年侦探团们。柯南他们去拾柴，发现了一个山洞，进去一看碰到了正在搬运尸体的可疑男子。柯南被犯人的枪射中了。
第189集 生死一瞬间-负伤的名侦探
把重伤的柯南背在背上的侦探团们根据洞里的暗号开始寻找出口。好容易找了出口后，犯人追了出来被正好赶来的目暮警官们带走了。柯南被迅速送到了医院。小兰确信了柯南就是新一。
第190集 名侦探遇害记-第三个选择
柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼时，当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。
第191集 名侦探遇害记-黑衣骑士
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时出现了意外的人物！
第192集 生死一瞬间-新一回来了
变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的了望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
第230集 谜样的乘客1（前篇）
GIN与VODKA在密谈，然后又来了VERMONT。博士与少年侦探团坐巴士汽车去滑雪旅行。途中站上又有其他客人和新出医生、朱蒂老师一同上车
第231集 谜样的乘客（后篇）
突然灰原开始颤抖……这时有个两个男人持枪劫持巴士。柯南等人遇到了巴士劫持，柯南发现到除了这两个男人之外还有一名同伙。劫持犯以为可以无事脱逃却不意启动了炸弹的起爆装置。灰原还在巴士中……
第321集 消失的绑架逃逸车（前篇）
柯南去看望同学片冈纯，结果被人误认为是纯而遭到绑架。很快，绑架犯吉泽正向纯的父亲片冈茂电话要求赎金3千万圆。并且指名交付赎金的得是片冈的将要再婚的对方江崎幸子。吉泽在公园得到放有幸子送去的赎金的蜂蜜便当，乘轻四轮车逃走。但是，在警察的追踪中，车子突然在隧道里消失了。
第322集 消失的绑架逃逸车（后篇）
被误认为同学片冈纯而遭到绑架的柯南成功的从废弃建筑的地下室逃脱回来。很快绑架犯吉泽正发现被绞死在停在停车场的轻型四轮车中。看到车子的柯南确信这就是运走自己的绑架逃逸车。并且注意到了车子接到赎金从隧道中消失的手法……
第331集 疑惑的咖喱饭(前篇）
受园子的邀请，到轻井泽游玩的柯南、兰、小五郎，因为在森林中迷了路，所以决定在山里的一轩家借宿。在那里，与白天遇见的网球教练明石宽人再次相遇。但是，在那天夜里，却发现了宽人的父亲岩夫上吊的尸首…在轻井泽玩的时候柯南他们在森林中迷路了，就住在了网球教练明石宽的家里。
第332集 疑惑的咖喱饭（后篇）
但是就在那天晚上，柯南和小兰却发现了明石宽的父亲吊死在家里。警察虽然推断是自杀，但柯南还是从附近的线索里将凶手的真面目揭露出来 。但是，在关键时刻柯南却因为感冒不能发声了…
521 杀人犯、工藤新一
收到自称屋田诚人寄来的关于1年前工藤新一所破解的杀人事件的推理存在疑点的信的平次，约上小五郎、柯南、小兰、和叶前往东奥穗村。平次等人在拜访村公所的时候，柯南则独自一人进入了森林。原来随信还有附寄给新一的一封信，约在山中小屋见面。此时，柯南突然感到莫名的痛苦。原来柯南在感冒后，从阿笠博士那里得到的药，居然是小哀研究出的APTX4869的解毒剤的试制品。小兰等人为寻找柯南，进入森林，却意外与新一相见。但是，新一因丧失记忆，甚至连小兰都忘记是谁了…。
522 新一的真相隐藏于小兰的眼泪之中
为了找寻丧失记忆的新一而走入森林的小兰，在撞见死罗神后滑落悬崖昏迷过去。此后，平次等人在山中小屋发现了不知去向的小兰。平次发现了化妆用的白色假发，认定这个小屋的主人就是死罗神。随后在小屋内发现了被粉碎地劈开的新一的照片和零乱的镜子碎片的平次，参透了事件的真相，让城山召集大家到泷德家。然后，平次开始在大家聚集的泷德家进行解谜。原先认定新一不可能刺杀他人的平次，却清楚的断定新一正是那刺入他人要害的真凶…
523 真正想问的事
在高速公路上驾车行驶的古城郡平被人勒死了。但是车子依旧在古城的驾驶下行驶着。嫌疑犯是沟端理子，忠田笃男，下鸟太志3人。理子是古城的女友，忠田是与古城率领的暴走族队伍对抗的另外一只队伍的领队。下鸟则是不久前因交通事故而死的古城队伍的队员彰的父亲。就在新一和平次共同识破犯人诡计的时候，却感到要变回柯南的前兆袭来…。
柯南剧场版
第1弹 引爆摩天楼
某天，柯南在整理信件时，发现了一封寄给自己的信，原来是有名的建筑师－－森谷帝二邀请新一去参加他举办的茶会。没办法以新一身份去参加的柯南，打电话要小兰等人代替他去，但小兰开出另一个条件，要新一和她在5月3日晚上十点一起去看电影。原来5月4日那天是自己的生日啊！柯南都把这件事给忘了。在茶会上小兰和森谷帝二谈起要和新一约会的事。
到了5月3日当天下午，小兰便出门了。柯南在无可奈何之际，看见新闻说火药库的火药被窃，而且最近发生了许多纵火事件，似乎都出自同一人之手；而后这个犯人打电话给新一，声称手里有炸弹，要新一马上到堤向津川绿地公园，不然就会有人死。柯南用划板迅速赶往公园，发现侦探团的孩子正在玩一架来由不明的轰炸机。虽然柯南击毁了飞机，但还是发生了爆炸。
这时罪犯又来电话，说3点在米花车站广场会有炸弹爆炸，提示是在树下。柯南来到车站，发现原来炸弹是放在一个装猫的宠物篮内，因为日语树根和猫同音，但篮子被人拿走了。柯南好不容易才追到篮子，可只剩20秒了，这时记时器突然停了，但柯南刚把炸弹带走一会儿就又开始跳动。柯南将炸弹带离人群，但炸弹还是爆炸，他也受了伤，进了医院。
在医院里大家怀疑是新一的仇家干的，新一曾破的最有影响的案子是西多摩市的冈本市长开车撞人案，那个市长因为此案而下台，西多摩市的市政建设计划也因此而取消了……不久犯人又来电话，声称在东京都环状线上装了5颗炸弹，在下午4点后，行驶的列车速度不满60公里，或太阳下山了，那么就会爆炸，提示是炸弹在“XX之X”，而侦探团的孩子也在车上。柯南从太阳能想到，炸弹是在“铁轨之上”，但事后发现用去的炸药只是被偷的1/4。
白鸟警官发现几处被破坏的建筑都是森谷帝二30岁前设计的，大家来到森谷帝二家调查，柯南在他家的作品展览室发现了西多摩市的市镇建设计划模型……没多久柯南就使犯人露出了原形。看似结束的事件却尚未结束，犯人说他已把最大的炸弹放置在米花市政厅中了，而且……那不是小兰正处在的地方吗！此时离爆炸时间已所剩不多了……柯南尽全力来到大楼内，用电话联系小兰教她如何拆炸弹。最后，只剩下两条电线，到底应该剪哪条呢？是剪有小兰和新一的幸运色的那条？……此时是5月4日零点！
第2集 14番的目的
正在慢跑的目暮警官遭人用十字弓射伤而住院了，就在第二天，小兰的母亲—妃英理吃了被人下毒的巧克力，昏倒在事务所里，紧接著阿笠博士也被歹徒用十字弓射伤，每一个凶案现场都分别留下了有关黑桃扑克牌上K、Q、J上的物 品，三人的名字内都有13、12、11的数字，且被害者都与小五郎有关系。到底这张扑克牌代表著什麼？难道是死亡……
根据线索，目暮警官推断犯人可能是……十年前，扑克牌赌场的经营人村上丈，被当警察的小五郎逮补。侦讯中，村上丈藉口内急而挟持了来找小五郎的英妃理，企图逃走。枪法一流的小五郎第一枪掠过英妃理的腿部，然后再一枪击中村上丈，才结束了这场惊险的事件。之后小五郎引咎辞职了，妃英理也和小五郎分了居。这件事对小兰的打击非常大，她从此对父亲失去了信心。而村上丈在上个礼拜假释出狱了……
怪异的连续袭击事件是按照著扑克牌的顺序进行的，这一次出现的牌面是黑桃十。遭到犯人狙击的是小五郎打高尔夫的球友十弘树。柯南等搭乘十弘树所驾驶的直升机，弘树驾驶前必要点的维他命被人给掉包了，眼睛遇太阳刺眼得张不开，失去了视力，所幸柯南及时降落，逃过了一劫而黑桃十出现在迂弘树家中。凶手的杀机笼罩著所有和小五郎有关的众人……\r
为了名字里有九的旭胜义，大家随泽木公平来到了著名的海上娱乐中心乐乐广场。柯南发现了现场的人们名字中都含有「数字」。难道犯人把所有的猎物都一网打尽吗？在海底餐厅里，他们并没有发现嫌犯--村上丈的踪影，却发现了主人旭胜义留下的纸条。在酒室中泽木公平遭袭。当大家回到餐厅时，却发现了实业家旭胜义的尸体。
被困在大厅里的众人纷纷找寻出口，刹那间灯熄了！名模特儿小山内奈奈的手却发出了闪光，然后惨遭毒手，而在她的尸体旁边有一张黑桃七的扑克牌。此时巨大的爆炸声响起，犯人炸毁的餐厅。大家逃离了海底，正当柯南指正凶手时，凶手捉了小兰当人质，并要柯南将手枪丢给他，一切的景象就跟小五郎当年面对村上挟持妃英理做人质一样……
第3集 世纪末的魔术师 星之光芒
罗马王朝的皇室秘宝－回忆彩蛋，将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时，怪盗KID寄出「犯案预告信」准备夺取这无价的皇家艺术之宝，于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查，以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪，遇到服部平次，便一同侦查此案。在美术馆遇到了苏联大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。
看完彩蛋，大家便解读预告信线索，不料将时间、地点都解读错误。而KID窃听到彩蛋被转移了。在疏于防备的情况下，KID 成功地找到了回忆彩蛋。虽然柯南已经发现了KID的行动，看还是晚了一步。KID在逃离途中，却被神秘的杀手狙击，坠海失踪，生死不明。 柯南以新型滑板追踪，夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美小姐，从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。
柯南看了原稿后，认为彩蛋有两颗，而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡，所以大伙儿及对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索 ，找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上，摄影师寒川被杀，而且和KID相同是被击中右眼。木暮带着白鸟赶到，调查后柯南发现凶手可能是职业杀手史考兵。而白鸟却几次揭穿柯南的提示，使小兰对柯南的身份起了怀疑。
到达东京后，大家前往城堡，阿笠博士为了送做给柯南强化的眼镜，与灰原哀 也一同出发至城堡，不料少年侦探团也藏身在车上跟踪而行。在城堡中，柯南意外发现通往地下室的通道，在秘道中珠宝商干被杀。而其他人在一个棺木中发现了第二个蛋，并明白了回忆之卵的真正含义。
但专门狙击人右眼的神秘杀手「史考兵」也在人群之中…… 他再次行动，目标是小五郎和小兰，刺杀失败后凶手抢走了彩蛋，并想烧毁城堡。柯南追赶凶手，在熊熊大火中，凶手露出了她的真面目……柯南在白鸟的帮助下逃出了火海。回家后小兰对柯南(新一)的真实身份再次起了疑问，正当柯南要说出真相时，KID假扮的新一出现了，帮柯南解了围……
第4集 瞳孔中的暗杀者
一个雨天柯南刚和小兰打晚电话，在回家的路上遇到了步美他们。众人在马路旁看到一个很象刑警的人，可谁知刚走过马路，就看到这位刑警被人枪杀。大家都没看清杀手的样子，唯一了解的是，凶手是个左撇子。几天后，又一名刑警死在一幢大楼的停车场，手上握着一本警用手册。
几天后,在白鸟警官妹妹的订婚PARTY上,毛利一家人及众多警官纷纷到场，连刑事科局长也到了,PARTY上当毛利问起两起凶案时，白鸟对他说:"Need not to know.(你无需知道)(知る必要のたぃ事)"这是警界的隐语，意思是该案与警界人士有关。不久突然停电，在洗手间的小兰和佐藤,摸索间小兰发现并拿出了放在暗处的手电，枪声响起，佐藤中枪，小兰失去知觉。
众刑警立刻调查，可在大楼里没有一人身上发现有硝烟反应，而小兰却失忆了。终于木暮说出了原委，原来在一年前的一个凶案中，由于案件与刑事局长儿子有关而未有深查。此案被断为自杀，而被害者的妹妹及一名因此案牺牲的警官的儿子却一直对此事耿耿于怀。最近警方又派当时的几名警官重查此案，但调查的三个人却接连遭袭。
柯南记起当天在PARTY确实有几个可疑人物，并推测小兰可能看到了凶手的样子。不久失忆的小兰出了院。虽然警方已派人日夜保护，但小兰还是差点被火车撞到，多亏了柯南才捡回一命。为了保护小兰，柯南开始调查，在与几位当事人接触后，柯南发现了一连串线索，并揭开了无硝烟反应的开枪方法。
同时小兰记起曾经去过的热带乐园，为了不让柯南担心，小兰与小五郎等人偷偷的去了游乐园。在那里少年侦探团制服了一个可疑人物，但真正的凶犯还未出现。晚上，小兰遭到凶手的狙击，而此时柯南还在赶往游乐园的路上。不久两人相遇，在与凶手20分钟的周旋后，凶手终于在柯南的超强球鞋及小兰的空手道的连击下被捕了，小兰恢复了记忆，佐藤警官也恢复了清醒。
第6集 贝克街的亡灵
东京。米花市。米花某会堂这里正要举行能够刷新世界游戏业界的超级实感次世代游戏－－“考克恩”的发布会。集结现代最高科技制作而成的“考克恩”，是玩家乘坐茧状密闭舱，通过电脑模拟再现历史上事件、以假眠状态挑战该事件的假象实感游戏。被邀请参加发布会的柯南、兰、灰原以及少年侦探团一行，夹杂在同时被邀请而来的政界、财界、艺能界等各界代表的孩子们当中，纷纷乘上“考克恩”。然而，等待着他们的却是毫无征兆的突发事件。 制造“考克恩”的最高担当者坚村被杀害了，与此同时，名为“诺亚方舟”的人工智能入侵了“考克恩”的电脑，中断了一切外部*作。柯南他们被带到了100年前阴暗浓雾重重包围下的伦敦，身处新一无比崇拜的夏洛克.福尔摩斯所生存的那个时代！ 开始暴走的这个游戏向被困在假象世界的50个孩子、以及现实世界当中的客人们发出了宣言： 以解决历史案件为主题的这个游戏中，只要有一个人幸存下来就是你们获得胜利。但是，假如没有人能够幸存，则所有参加的人全部性命难保！” 在此活动中，还邀请了一位世界级的推理作家作为嘉宾，那就是知道柯南真实身份的新一之父－－工藤优作。优作一边努力揭开坚村被害之谜，一边守护着柯南他们。柯南一行也拼命徘徊在北“考克恩”真实再现的19世纪末的伦敦街道上，开始了向夏洛克。福尔摩斯所活跃过的贝克街事件的挑战！ 这是以卷入“虚幻与现实”中的50个孩子的生命为赌注的死亡游戏！在19世纪末，柯南到底遭遇了什么样的事件？！面对层出不穷的诡计，在虚幻与真实相交错的两个世界里，柯南与推理能力凌驾自己之上的父亲分别会展开何种精彩推理……？！
第7集 迷宫的十字路
在东京有个“西国立市”神社，那里有三名可疑男子在密谈。突然有个戴着老翁面具的黑影男人出现，用日本刀和弓箭在瞬间将三人杀害。与此事件同时，大阪，京都也相继发生了杀人事件。
根据搜查的结果，警视厅发布，被杀的5人都是往返东京?大阪?京都三大城市盗窃著名佛像和美术品的盗窃集团成员。他们似乎是以日本历史上最有名的悲剧武将——源义经的故事《义经记》为名，首脑化名“义经”，部下以“弁庆”为首，各自以家将姓名相称。是对盗窃集团怀恨之人所为吗？还是内部分裂而杀人呢？警视厅对犯罪动机也没有掌握有力的线索…… 一方面，小五郎带着柯南，兰，园子到访京都。在由绪的寺院——山王寺的住持告诉他们，8年前国宝级的佛像被盗走了，委托他们解读可以判断佛像藏匿地点的迷样的画像。
柯南从佛像被盗的事情怀疑是盗窃集团所为，事件开始向破解的方向进展。但很快，在他到达义经?弁庆的传说流传的make by whyarmy历史遗迹——最著名的京都五条大桥开始追寻时，有个手持竹刀的男人突然来袭！ 在京都的五条大桥上，高个男子弁庆挥起长刺刀，牛若丸刀直劈而下！在栏杆上瞬间闪过的柯南惊奇的看到那个男子！那个男子竟是与工藤新一并称的西部高中生侦探-服部平次。平次是知道柯南的真实身份就是工藤新一的少数几人之一。他也是为了追寻在大阪发生的盗窃集团成员被杀事件的真相到了京都。总是在较劲的柯南与平次这次为了查出事件的真相而戮力合作。
但是，两人身边有个戴着老翁面具的黑影男人！ 在绵密交织的京都十字路口上，隐藏于历史暗影中的谜团与陷阱向柯南等人袭来！棘手案件与敏锐推理，友情与恋爱……
第10集 侦探们的镇魂歌1
因为受到谜一样的男子的委托，小五郎和柯南他们一行人来到了横滨。
可是，不慎落入那个男子设下的圈套，兰和少年侦探团成为了人质。限时12个小时。
如果在12个小时里，无法解开委托的事件的真相，安装在兰他们身上的炸弹就会爆炸。而且，那个男子知道柯南就是工藤新一！
“关西高中生侦探”服部平次和怪盗KID也将登场！！
限定的时间一步步逼近。柯南他们能否解开事件的真相，及时将兰他们平安无事地解救出来！？
那个谜一样的委托人，黑色身影的真面目是......
第11集 绀碧之棺1
在小五郎的带领下，柯南一行人前往位于太平洋上的小岛“神海岛”上享受愉快的假日，蔚蓝色的大海和无限的自然风光加上自古以来流传的两个“神海岛”传说让这个小岛成为游客成群的度假圣地。兰和园子在“海底宫殿”附近的海域享受有氧潜水，少年侦探团则玩起了神海岛观光课安排的寻宝游戏。然而，觑意于传说中的财宝的宝藏猎人们也潜入了这个迷人的小岛上。兰和园子意外的遭遇到一名被鲨鱼群袭击的宝藏猎人，猎人的死是因为传说中的宝藏吗？急忙赶来的柯南发现了死亡的疑点，并和灰原一起展开了调查。
“神海岛”流传这两个传说，一个是沉入海底的古代遗迹“海底宫殿”，它是沉入神秘岛海域的巨大岩石建筑群，虽然研究者纷至沓来，但始终没有人能解开“海底宫殿”的秘密，另一个传说是300年前活跃在加勒比海的2名女海盗“安妮·邦尼”和“玛莉·雷德”遗留下来的财宝，据说她们乘坐的海盗船遭到英国海军的攻击时，只有她们2人勇敢的战斗。随着调查的深入，迷一般的文字“Jolly Roger”浮出水面，宝藏的秘密近在眼前。然后要接近真相总要经历磨难，柯南他们找到的一部分财宝被谜一样的宝物猎人抢走了，而宝藏猎人的魔手也伸向了兰和园子，他们的目的究竟是什么？隐藏在传说中的真相是什么？隐藏在海底宫殿中的秘密又是什么？超越300年的暗号，柯南一一解明。
柯南vs鲁邦三世（2小时特别版）（被冻伤）
你要的文件如下
TV版
1 云霄飞车杀人事件 （被GIN打伤头部并灌下APTX-4869）
2 董事长千金诱拐事件 （被绑架犯殴打，多处受伤）
11 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件 （被浅井尉中从楼上扔下去）
15 消失的尸体杀人事件 （被凶手殴打）
33 侦探团生还事件 （多处擦伤）
34 山庄绷带怪人杀人事件（上集）（为救小兰脚腕扭伤）
35 山庄绷带怪人杀人事件（下集）
43 江户川柯南绑架事件 （被迷晕）
49 外交官杀人事件（下集）（感冒发烧）
48 外交官杀人事件（上集）
63 大怪兽哥梅拉杀人事件 （割伤手指）
68 暗夜男爵杀人事件（事件篇）（被“暗夜男爵”从二楼丢到游泳池里）
69 暗夜男爵杀人事件（疑惑篇）
70 暗夜男爵杀人事件（解决篇）
81 当红歌手绑架事件（上集）
82 当红歌手绑架事件（下集）（被绑匪殴打）
118 浪花连续杀人事件 （被邵渊己一郎用刀刺伤）
128 黑暗组织10亿抢劫事件 （被宫野明美打昏）
132 魔术爱好者杀人事件（事件篇）（发烧后晕倒）
133 魔术爱好者杀人事件（疑惑篇）
134 魔术爱好者杀人事件（解决篇）
136 蓝色古堡搜索事件（上集）（调查时被犯人偷袭，昏了过去）
137 蓝色古堡搜索事件（下集）
188 危命的复活 洞窟内的侦探团 （被犯人开枪击中腹部，最危险的一次，接受小兰的输血）
189 危命的复活 负伤的名侦探
190 危命的复活 第三个选择
230 诡密的乘客（上集）
231 诡密的乘客（下集）（救灰原时胳膊、腿部受伤）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追击篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）（缺氧晕了过去）
316 被玷污的蒙面英雄（前篇）
317 被玷污的蒙面英雄（后篇）（被凶手殴打，卡住脖子）
321 消失的绑架逃逸车（前篇）（被绑架犯误绑，轻微擦伤）
322 消失的绑架逃逸车（后篇）
331 疑惑的咖喱饭（前篇）（本来就感冒，又被撞进了河，胳膊扭伤，嗓子还哑了，办案遇到了很大的困难）
332 疑惑的咖喱饭（后篇）
345 与黑暗组织正面对决 满月之夜的双重推理 （开头时被传染感冒，又被自己的麻醉针睡着，还中了贝尔摩得的催泪瓦斯）
521 杀人犯 工藤新一 （感冒，又掉入湖中，感冒加重）
522 新一的真实身份与兰的眼泪
554 鹳的探索之旅（搜索小兰篇）（脚扭伤）
555 鹳的探索之旅（追踪阳菜篇）
563 侦探团VS强盗团（骚乱）
564 侦探团VS强盗团（沉默）（被抢匪卡住脖子）
586 黑暗中消失的麒麟之角 （被基德用电击枪击晕）
587 基德VS四神侦探团
597 蒸汽密室的剧本（前篇）
598 蒸汽密室的剧本（后篇）（被灰原的辣椒伤到）
剧场版
M 1 引爆摩天楼 （为救行人被炸弹炸伤，撞伤头部）
M 2 第十四个目标 （为救小兰差点溺水）
M 3 世纪末的魔术师 （与犯人搏斗时受伤）
M 4 瞳孔中的暗杀者 （为救小兰擦伤）
M 5 通往天国的倒计时 （进行滑板飞越时擦伤）
M 6 贝克街的亡灵 （被红酒淹了）
M 7 迷宫的十字路 （变回新一后被打）
M 10 侦探们的镇魂歌 （追捕犯人时扭伤）
M 11 绀碧之棺 （为救小兰差点溺水）
M 12 战栗的乐谱 （被犯人打晕）
M 13 漆黑的追踪者 （被Irish打伤，被武装直升机的子弹擦伤）
M 14 天空中的遇难船 （脸被子弹擦伤，然后在飞艇顶上多处中弹）
M 15 沉默的十五分钟 （被雪崩埋住）
OVA 9 十年后的陌生人（感冒发烧）
合作特别篇《鲁邦三世 VS 名侦探柯南》（轻微冻伤）
请及时查收
资料整理自柯南吧
如有疑问 请追问
满意的话 望采纳
谢谢本回答被提问者采纳
1 云霄飞车杀人事件 （被GIN打伤头部并灌下APTX-4869）
2 董事长千金诱拐事件 （被绑架犯殴打，多处受伤）
11 钢琴奏鸣曲《月光》杀人事件 （被浅井尉中从楼上扔下去）
15 消失的尸体杀人事件 （被凶手殴打）
33 侦探团生还事件 （多处擦伤）
34 山庄绷带怪人杀人事件（上集）（为救小兰脚腕扭伤）
35 山庄绷带怪人杀人事件（下集）
43 江户川柯南绑架事件 （被迷晕）
49 外交官杀人事件（下集）（感冒发烧）
48 外交官杀人事件（上集）
63 大怪兽哥梅拉杀人事件 （割伤手指）
68 暗夜男爵杀人事件（事件篇）（被“暗夜男爵”从二楼丢到游泳池里）
69 暗夜男爵杀人事件（疑惑篇）
70 暗夜男爵杀人事件（解决篇）
资料拓展：
他因为试图跟踪黑衣组织成员而被偷袭，并被灌下代号“APTX4869”的毒药，虽然幸免未死，但
身体就此缩小成一年级小学生的模样。
本回答被网友采纳第1集 云霄飞车杀人事件
会现场发生山崎总经理被害事件。解决这个事件的是以福尔摩斯式的推理能力而声名大噪的高中生侦探——工藤新一。在和青梅竹马的毛利兰一起去游乐园玩、乘坐云霄飞车时一名男子惨遭杀害……
第2集 董事长千金绑架事件 在现场目击黑衣男子犯罪的新一遭袭击昏迷，并被强灌不知名的药。醒来时竟变成一个小孩！于是暂时住到了女友兰的家里、这时小五郎接到了诱拐事件的委托…
第187集 黑暗中的神枪响
小五郎接受古川悦子的委托保护它的母亲。然后在古川家等待悦子回来的时候知道了家属和女佣之间发生了很多金钱上的纠纷。悦子回来后去母亲的房间叫母亲时从母亲的房间传来了枪声。
第188集 生死一瞬间-侦探队洞窟探险记
和阿笠博士去露营的少年侦探团们。柯南他们去拾柴，发现了一个山洞，进去一看碰到了正在搬运尸体的可疑男子。柯南被犯人的枪射中了。
第189集 生死一瞬间-负伤的名侦探
把重伤的柯南背在背上的侦探团们根据洞里的暗号开始寻找出口。好容易找了出口后，犯人追了出来被正好赶来的目暮警官们带走了。柯南被迅速送到了医院。小兰确信了柯南就是新一。
第190集 名侦探遇害记-第三个选择
柯南正在为是否告诉小兰自己的真相而烦恼时，当天夜晚，灰原出现在了柯南的病房并把枪口对准了柯南！同时小兰的学校正在准备文化节，柯南也去看了小兰主演的话剧。但是观众中的一个男子突然倒下死了。
第191集 名侦探遇害记-黑衣骑士
在小兰主演的话剧的表演中，发生了杀人事件。目暮警官认为被杀害的蒲田的饮料中被他的同伴们下了毒，但是从现实情况来说准备断定是自杀。此时出现了意外的人物！
第192集 生死一瞬间-新一回来了
变回原来的身体的新一回到原来的生活的时候，在米花中心大厦的了望餐厅邀请兰吃晚餐。晚餐时听说在餐厅的电梯里发生了杀人事件的新一对兰说“马上回来”，奔向了案发现场。
第230集 谜样的乘客1（前篇）
GIN与VODKA在密谈，然后又来了VERMONT。博士与少年侦探团坐巴士汽车去滑雪旅行。途中站上又有其他客人和新出医生、朱蒂老师一同上车
第231集 谜样的乘客（后篇）
突然灰原开始颤抖……这时有个两个男人持枪劫持巴士。柯南等人遇到了巴士劫持，柯南发现到除了这两个男人之外还有一名同伙。劫持犯以为可以无事脱逃却不意启动了炸弹的起爆装置。灰原还在巴士中……
第321集 消失的绑架逃逸车（前篇）
柯南去看望同学片冈纯，结果被人误认为是纯而遭到绑架。很快，绑架犯吉泽正向纯的父亲片冈茂电话要求赎金3千万圆。并且指名交付赎金的得是片冈的将要再婚的对方江崎幸子。吉泽在公园得到放有幸子送去的赎金的蜂蜜便当，乘轻四轮车逃走。但是，在警察的追踪中，车子突然在隧道里消失了。
第322集 消失的绑架逃逸车（后篇）
被误认为同学片冈纯而遭到绑架的柯南成功的从废弃建筑的地下室逃脱回来。很快绑架犯吉泽正发现被绞死在停在停车场的轻型四轮车中。看到车子的柯南确信这就是运走自己的绑架逃逸车。并且注意到了车子接到赎金从隧道中消失的手法……
第331集 疑惑的咖喱饭(前篇）
受园子的邀请，到轻井泽游玩的柯南、兰、小五郎，因为在森林中迷了路，所以决定在山里的一轩家借宿。在那里，与白天遇见的网球教练明石宽人再次相遇。但是，在那天夜里，却发现了宽人的父亲岩夫上吊的尸首…在轻井泽玩的时候柯南他们在森林中迷路了，就住在了网球教练明石宽的家里。
第332集 疑惑的咖喱饭（后篇）
但是就在那天晚上，柯南和小兰却发现了明石宽的父亲吊死在家里。警察虽然推断是自杀，但柯南还是从附近的线索里将凶手的真面目揭露出来 。但是，在关键时刻柯南却因为感冒不能发声了…
521 杀人犯、工藤新一
收到自称屋田诚人寄来的关于1年前工藤新一所破解的杀人事件的推理存在疑点的信的平次，约上小五郎、柯南、小兰、和叶前往东奥穗村。平次等人在拜访村公所的时候，柯南则独自一人进入了森林。原来随信还有附寄给新一的一封信，约在山中小屋见面。
此时，柯南突然感到莫名的痛苦。原来柯南在感冒后，从阿笠博士那里得到的药，居然是小哀研究出的APTX4869的解毒剤的试制品。小兰等人为寻找柯南，进入森林，却意外与新一相见。但是，新一因丧失记忆，甚至连小兰都忘记是谁了…。
522 新一的真相隐藏于小兰的眼泪之中
为了找寻丧失记忆的新一而走入森林的小兰，在撞见死罗神后滑落悬崖昏迷过去。此后，平次等人在山中小屋发现了不知去向的小兰。平次发现了化妆用的白色假发，认定这个小屋的主人就是死罗神。随后在小屋内发现了被粉碎地劈开的新一的照片和零乱的镜子碎片的平次，参透了事件的真相，让城山召集大家到泷德家。然后，平次开始在大家聚集的泷德家进行解谜。原先认定新一不可能刺杀他人的平次，却清楚的断定新一正是那刺入他人要害的真凶…
523 真正想问的事
在高速公路上驾车行驶的古城郡平被人勒死了。但是车子依旧在古城的驾驶下行驶着。嫌疑犯是沟端理子，忠田笃男，下鸟太志3人。理子是古城的女友，忠田是与古城率领的暴走族队伍对抗的另外一只队伍的领队。下鸟则是不久前因交通事故而死的古城队伍的队员彰的父亲。就在新一和平次共同识破犯人诡计的时候，却感到要变回柯南的前兆袭来…
柯南剧场版受伤
第1集 引爆摩天楼
第2集 14番的目的
第3集 世纪末的魔术师 星之光芒
第4集 瞳孔中的暗杀者
第7集 迷宫的十字路
第11集 绀碧之棺1
柯南vs鲁邦三世（2小时特别版）