法律分析：存在区别。
1、两者缴纳社保的险种不同：个体户缴交社保只要缴交养老保险和医疗保险两个项目。相当于居民社保，也就是说个体户只能参加居民社保，而不能参加职工社保。而公司为员工缴交企业社保需要缴交五项内容：养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险。职工社保只有公司企业单位才能参保缴费。
2、两者需要承担的社保费用不同：个体户自己缴纳社保，费用全额由个人承担，个人可根据自身条件选择社保缴纳基数。个体户参加的居民社保，参保基数都是都个人自己选择的。公司为员工缴纳社保，费用是由公司与员工个人共同承担，员工只需要承担一小部分，一般员工的社保费用由公司先出，然后在员工的工资中扣除相对应的社保费用。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第四条 中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。
个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。
第五十八条 用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。
自愿参加社会保险的无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，应当向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
国家建立全国统一的个人社会保障号码。个人社会保障号码为公民身份号码。