不会，一号线是从滨湖新区到火车站的，不走南站过。
1号线连接南北
根据已经亮相的可研规划，合肥轨道交通1号线的走向为南北走向。其整条线路北起火车站北的天水路，沿新蚌埠路向南，经北二环，下穿合肥站，沿胜利路、马鞍山路向南，至望湖中路向西转，再向南直穿高铁站，随后沿青海路、庐州大道、珠江路至线路终点站徽州大道站。据悉，1号线线路全长约28.8公里，全部为地下线。全线26座车站，全部为地下车站。其中，合肥站以南部分为1号线一期工程，以北为后期建设部分。
参考资料：http://www.wolai.com/news/2010-07-23/23557/