北京最好的男科医院包括：北京协和医院、北京大学第三医院、北京仁和医院等。
一、北京协和医院
北京协和医院是中国知名的综合性医院，其男科诊疗在国内处于领先地位。该医院拥有先进的医疗设备、资深的医护团队以及丰富的临床经验。协和医院男科诊疗覆盖面广，涵盖了前列腺疾病、性功能障碍、生殖健康等多个领域。
二、北京大学第三医院
北京大学第三医院男科也是北京地区享有盛名的男科医疗机构。该医院在男性生殖健康、性功能障碍、泌尿系统疾病等领域有着深入的研究和丰富的临床经验。医院拥有一支专业的男科团队，能够为患者提供个性化的诊疗服务。
三、北京仁和医院
北京仁和医院男科在男性健康领域也有着较高的声誉。该医院拥有先进的医疗设备和技术，能够开展各种男科疾病的诊疗工作。从前列腺疾病到性功能障碍，从生殖健康到泌尿系统疾病，仁和医院都能提供全面的医疗服务。