肠上皮化生疾病可根据其特征分为两种主要类型：小肠型化生和结肠型化生。通过黏液组化染色技术进行区分，小肠型化生也被称作完全性肠上皮化生，其上皮分化良好，是一种常见的胃黏膜病变。据统计，小肠型化生在各种良性胃病中检出率较高，达到57.8%，尤其常见于慢性胃炎患者，且随着炎症的进展，化生程度会加深，可能反映炎症反应的特性。
相反，结肠型化生，即不完全性肠上皮化生，其上皮分化较差。在良性胃病中，结肠型化生的检出率相对较低，仅有11.3%。然而，值得注意的是，在肠型胃癌旁的黏膜中，结肠型化生的检出率高达88.2%，这表明结肠型化生与胃癌的发生有密切关联。因此，对于结肠型化生，其潜在的致癌风险不能忽视。
胃粘膜的肠上皮化生或简称为肠化生，是一种比较常见的现象，特别是在高龄人更为多见。肠上皮化生常常合并于慢性胃炎，特别是慢性萎缩性胃炎。由于胃病检查技术的发展，特别是胃镜的应用，早期胃癌的大量发现与研究，认为胃粘膜肠上皮化生与胃癌有密切关系。