2011年1月14日晚上10时,武汉铁路局襄樊北机务段(现为襄阳机务段)的HXD1C型0007号机车,附挂HXD1C型0036号机车,担当5096次单机经由襄渝铁路运行至襄阳市谷城县五山镇境内黄家营站附近、K41+530M处时,突然实施紧急制动停车。但由于机车在紧急制动中大量撒砂,机车制动后也未按规定前移15米,导致轨道电路分路不良,防护该闭塞分区的通过信号机仍显示绿灯。后续由襄樊北机务段HXD1C型0035号机车牵引的10906次货物列车,按机车信号和地面信号显示的绿灯运行,进入该闭塞分区,由于制动不及,以68公里/小时的速度与前方的机车追尾相撞。事故造成三台机车脱轨,经修复后正常运行。此次事故性质与2009年6月发生的京包铁路列车追尾事故相同,均由于机车撤砂后轨道电路失效造成。
2014年11月24日下午15时许,成都铁路局重庆机务段的HXD1C型0033号机车,牵引的75228次货物列车(列车编组50辆,总重1,356吨)经由襄渝铁路运行,当列车运行至旬阳至棕溪间上行线K250+400~K249+870处(安康市旬阳县棕溪镇境内),因列车行驶方向右侧发生山体滑坡导致小棕溪隧道口塌方,造成75228次列车的机车和机后1~13位车辆脱轨,机车撞上隧道内壁,驾驶室严重变形,导致2名机车乘务员遇难。由于机车重量大,加之地形因素影响,为方便尽快清理现场打通线路,经成都铁路局同意,该台机车被就地拆解,之后机车得以从隧道中拖出 。