北冥神功更胜一筹。
一、吸取方式不同北冥神功遇到内力比自己内力更强的对手，可以选择回避，不去吸取。而吸星大法一旦吸人内力，无法避免，即使对方内力强于自己，也会产生隐患。北冥神功不仅需要身体接触，而且需要双方穴道接触后才能吸取，而吸星大法只要接触就能吸取对手的内力。
二、产生的后果不同北冥神功吸取对方内力之后，通过内功心法修炼便能够转化成自己的内力。虚竹吸取无崖子、李秋水和天山童姥三人两百多年的内力后，经过自身心法的转化后对自己并没有多大的危害。段誉修炼北冥神功后也曾有过内力不受自己控制的情况，日后习得大理段氏的内功心法，一日之间，各种内力化为己有。
吸星大法存在反噬的风险，吸收的内力始终未能为己所用，各种不同的真气在体内相互对抗，对自身有很大的伤害。这就好比别人给自己输血，输入的血液和自己的血型不一样，不同血型之间发生对抗，就会对自身产生危害。令狐冲用吸星大法吸收了很多人的内力后，身体极其痛苦，任盈盈帮他寻遍名医，尝试过无数的方法都无法根除。这一点较北冥神功有很大的不同。新版《笑傲江湖》中，任我行自创融功法门，虽然对身体损耗颇大，却是消解了吸星大法的隐患。
北冥神功是逍遥派创始人逍遥子自创的，与天山六阳掌、天山折梅手、凌波微步齐名，北冥神功吸取他人内力之后，需要另一套功法——逍遥派内功运用法门，将吸取的内力化为自己使用。
北冥神功和吸星大法有着本质上的区别，北冥神功吸人内力看似邪恶，其实是正宗的内家绝学，吸星大法源于北冥神功但不是北冥神功。吸星大法应该是传承者在传承过程中丢失了某些练功法门，造成吸星大法有反噬自己的危害。《天龙八部》中虚竹吸取李秋水、无崖子和天山童姥三人两百多年的内力后，这些功力存在他的丹田气海中。《笑傲江湖》中的令狐冲用吸星大法吸取内力之后，这些内力经常游走在他的五脏六腑、各处经脉中，所以吸星大法丢失的是关于丹田的练法。
综上所述，北冥神功要更胜一筹。