1、教义不同：
逊尼派是在不同的教派、学派、教法学派长期斗争中形成的一个具有自身文化传统的教派。其中尤以同什叶派的斗争最为剧烈。
什叶派为恢复失去的政权，曾以暗杀、起义、暴动等方式展开斗争，致使教派冲突日趋激化。什叶派提出的一系列政治、宗教主张，要求逊尼派人作出明确的回答，客观上促进了逊尼派教义、教理的发展。
2、主张不同：
除信安拉、《古兰经》和先知穆罕默德这些伊斯兰教的共同信条外，信仰伊玛目是什叶派的基本特点，并被定为信条之一。认为伊玛目是继穆罕默德之后穆斯林世界的领袖，伊玛目的权力应属阿里及其后裔。
什叶派最显著的主张就是，只承认阿里一个人作为哈里发的合法性 ，并有一些推崇阿里的仪式，所以什叶派又被人们叫做“阿里派”。
3、地位不同：
逊尼派为历代伊斯兰国家中央政权所奉行，先后被倭马亚王朝、后朝阿拔斯王朝、塞尔柱王朝（公元1055年～1157年）、埃及的阿尤布王朝（公元1171年～1250年）和马木路克王朝（公元1250年～1517年）、奥斯曼帝国等定为国教，得到官方扶植而广泛流传，故称“正统派”。
由于历史根源，什叶派特别尊崇以阿里及其子孙代表的先知的亲属后代。在什叶派的影响下，逊尼派也不得不为倭马亚王朝时期遭到批判的阿里“平反”，但是其在逊尼派信徒中的地位还是不能与什叶派相比。
参考资料来源：百度百科-什叶派
参考资料来源：百度百科-逊尼派
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