一、发行时间不同：
1.蓝宝石复刻：
2014年11月21日，在日本、韩国、北美等地发售，2014年11月28日在欧洲发售。
2.原版蓝宝石：
游戏最早于2002年11月21日在日本上市，后于2003年推出美版。
二、游戏平台不同：：
1.蓝宝石复刻：
2.原版蓝宝石：
原版蓝宝石的游戏运行平台为Game Boy Advance。
扩展资料
游戏背景：
《蓝宝石》游戏玩法和操作方式与前作基本相同，玩家以鸟瞰的视角操作主角进行游戏。与前作一样，游戏的主要目的是打败四大天王并完成神奇宝贝图鉴，同时挫败敌对组织的计划。本作所新增的元素包括双打对战与神奇宝贝的特性和135只新神奇宝贝。
由于GBA的功能较以前的主机有所增强，因此可提供4位玩家的联机对打。游戏可以连接任天堂E读卡机和其它第三世代游戏。
参考资料来源：百度百科-口袋妖怪红宝石·蓝宝石
参考资料来源：百度百科-口袋妖怪终极红宝石·始源蓝宝石
平台：
红蓝宝石版在GBA上运行。
终极红宝石和始源蓝宝石在3DS上运行，支持七国语言。
宝可梦：
能够超级进化的宝可梦数量增加，新的可以超级进化的宝可梦有：蜥蜴王、巨沼怪、勾魂眼、巨金怪、蒂安希、七夕青鸟、暴飞龙、长耳兔、差不多娃娃、呆壳兽、喷火驼、巨牙鲨、艾路雷朵、烈空坐、大针蜂、大比鸟、拉帝欧斯、拉帝亚斯、大钢蛇、冰鬼护。
固拉多和盖欧卡可以进行原始回归，变化后型态为原始固拉多和原始盖欧卡。
胡帕有新形态：解放的胡帕。
丰缘图鉴新增了艾路雷朵、大朝北鼻、黑夜魔灵、铃铛响、超甲狂犀、雪妖女、含羞苞、罗丝雷朵和自爆磁怪共9只第四世代宝可梦插入原编号中。
新增可以变装的皮卡丘，通过改变服装可以学习普通形态无法学会的招式。
无限宝可梦的超级进化形态可以进入飞行模式，使主角在全丰缘地方上空飞行，且可以寻找异次元入口，遇到第二世代、第四世代及第五世代的传说中的宝可梦，而它们都是由胡帕传送过来。
在第一轮游戏结束后，小田卷博士会再送出城都地区、合众地区和神奥地区的最初拿到的宝可梦，是不计配信、历代版本中送出最多初学者宝可梦的版本。
第一轮游戏后期可以遇见很多丰缘图鉴中没有的宝可梦，包括部分传说的宝可梦。
人物与剧情：
祐树和小遥可以获得超级手镯，主角服装变化接近绿宝石版，但是配色仍然与红宝石蓝宝石版相似。
开场首次使用旧版本画面到重制版本的过渡，本作中先是由神奇宝贝多功能领航员上的第三世代的画面之后过渡到重新制作的画面。
熔岩队和海洋队依然根据版本不同作为正义方或敌对组织，各成员都有了新的形象。
大量绿宝石版的剧情没有使用，剧情基本延续了红宝石蓝宝石版的原始剧情，但是也有些许修改。
在旧版本中某些剧情之间经过的路程被简化，在剧情后会自动前往目标地点，而不需要玩家自己前往，防止玩家在比较复杂的丰缘地图内迷路。
这也导致釜炎道馆和橙华道馆成为了可以连续挑战的两个道馆。
新增德尔塔篇章，大幅度修改烈空坐的剧情，并首次出现宇宙，代欧奇希斯也变为可在剧情中捕获。
大吾继续出现并作为引导主角的关键青年，而且在本作中他会寻找超级进化的秘密，并且担任丰缘地方的冠军。
在绿宝石版成为冠军的米可利会依照红宝石蓝宝石版是道馆训练家，不过玩家在德尔塔篇章仍可以挑战他在绿宝石版的冠军队伍。
因为新版本的丰缘图鉴比旧版本的新增了幼年宝可梦或能再次进化和分支进化的宝可梦，所以四天王芙蓉会在登入名人堂前使用黑夜魔灵，四天王波妮会在登入名人堂前使用雪妖女以及117号道路的宝可梦培育家郁惠会使用含羞苞。而满充的雄性拉鲁拉丝不再进化为沙奈朵，而是进化为更加符合其性别的艾路雷朵，且可以进行超级进化。
第一轮游戏完成后的动画变为了主角在丰缘地方进行主线剧情的照片片段，同时会出现当时在场的队伍内首只宝可梦。
与AZ的战斗类似，在结局最后会增加一场与祐树或小遥（视选择主角而定）的战斗。
新增加重要角色基利、露琪雅和希嘉娜。
地图：
紫堇市由露天城市变为了一座回字形二层建筑。
红宝石蓝宝石版中的对战塔和绿宝石版中的对战开拓区都未出现，取而代之的是对战名胜区。
弃船不再是一艘废船，而是被改造成为了观光地，称为海紫堇。
南方孤岛不再是需要配信才可以到达的地点，而是成为剧情必经之地。
新增加未拓森林、无名平原、未知洞窟、朦胧洞窟、歪穴、弓形之岛、秘密小岛、秘密海滨和秘密花田。
各个城市出现大量与卡洛斯地区有关的内容，如风野自行车店的自行车全部变为卡洛斯进口，紫堇市与密阿雷市成为友好城市，并出现卡洛斯的旅游信息等。
水静美术馆内出现部分第四世代的传说的宝可梦的画像。紫堇市二楼住宅区的其中一间房间出现幻彩水晶塔和精练之塔的相片。
功能：
秘密基地进化为超级秘密基地，并对应3DS的瞬间交错通信，也可以输出QR码（二维码），使用扫码功能让其他玩家读取。
时间系统根据第四世代之后的设定增加了昼夜设定。
宝可梦导航仪进化为宝可梦多功能导航仪，囊括了诸多新功能。
新增加会在地图上直接出现的宝可梦和忍足系统，可以利用轻推类比垫采用蹑手蹑脚的姿势靠近这些宝可梦。
新增训练家群聚对战。
飞翔可以前往城市之外的地点。
骑自行车可以进入高草丛。
可以同时拥有两台自行车。
新增改变背景音乐的功能。
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