一样的。
控制器都有刹车断电功能。大部分的电动三轮车通常后刹为脚刹，前刹为手刹。
电动三轮车的控制器的线通常比两轮电动车的线要粗一些。主要原因也是由于车子较重，阻力大，加上载货，需要输出较大的功率。如果线过细，很容易出现电缆线发烫导致线粘连到一起引起短路的情况。
相比于两轮电动车，三轮车速要慢一些，同样是高速度档，最多也就30多公里的时速。基本上比两轮的中速还慢一点。但电动三轮车起步的力气要比两轮的大得多。因此不少不是很熟练的人骑三轮车，起步不是很平稳。
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注意事项：
1、如果控制器上的插件与转把上的接触件不配套，为了应急可以将插件去掉，线于线之间直接连接。此时不要怕麻烦，一定要将街头接牢，如果有条件的话，最好用电烙铁将街头焊接牢固，然后用绝缘胶布包扎好，避免在以后的使用过程中留有隐患。
2、注意控制器与电动机之间连线的正、负极。如果发现电动机出现倒转的情况，将电动机的正、负极颠倒即可。
3、控制器的输出功率与电动机功率要匹配一致，如果暂时找不到想匹配的控制器，宁可选用控制器的输出功率大于电动机功率的控制器，也不能选用控制器的输出功率小于电动机功率的控制器。换句话讲，宁可是大马拉小车，也不可小马拉大车。
参考资料来源：百度百科-电动车控制器
三轮电动车控制器与两轮电动车的控制器，基本功能是一样的。也就是原理都一样。
三轮控制器和两轮控制器只要度数一样，都是输出方波那种，比如两个都是120度或者都是60度，这样调下相位就可以互换了，要是度数不一样就不能用的。除了相位，功率和电压等参数也要匹配，另外就是三轮的倒车功能线不要接了，如果用在两轮上，如果两轮用三轮，要考虑倒车线的问题。
如果三轮是差速电机，还要考虑差速上的控制问题，也就是对应的两轮控制器要带这个控制功能。
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三轮电动车和两轮电动车区别：
第一都有刹车断电功能。大部分电动三轮车后刹为脚刹，前刹为手刹。前刹安装在左边。右边只有转把。由于电动三轮车骑行过程中惯性较大，前刹车主要起断电作用，辅助刹车作用。制动时刹车开关闭全，控制器停止供电，只起到了保护功率管的作用，又保护了电机，还节省电量。
第二欠压保护功能。蓄电池的电压放电到后面的阶段。在负载状态下，电源电压已接近电池放电终止电压。电池的终止电压为单块电池10.5V，有多少块电池，直接照乘。比如60V的5块电池，欠压保护值为52.5V。
第三过载保护，这个和电流过流保护差不多。三轮车本身比两轮电动车要重，空车恐怕比两轮车载人时的阻力还要大一些。
参考资料：百度百科-电动车控制器
本回答被网友采纳有些普通控制器虽有办法控制差速电机 ,但使用时明显发热量比以前的大.另外,一般商家不懂这之间的区别,假如你的车一定要差速控制器只能找专门生产控制器的厂家才可以,一般商家帮不了,或者假如商家跟厂家比较熟的话,叫商家帮忙跟厂家联系,并一定讲明是用在差速电机上的控制器.再或者如果你所在地方离我比较近的话或者你当地有卖我厂控制器的经销商的话,