原则上来说，专硕（也就是临床型）培养模式是硕士阶段2-6个月理论学习，其它时间临床实践，是否参与临床科研依你导师的课题需要决定，毕业时基本不需要提交科研课题数据，以培养具有高素质、强技能的临床医疗工作者（临床医师）为主，硕士阶段毕业后就业基本分布在地市级二甲医院左右，三甲医院对于硕士毕业院校（211或985）会有要求，因为一般三甲综合医院同为上述院校的教学或附属医院。但专硕考博难度相对科硕较难，名额较少。
原则上来说，科硕（也就是学术型）培养模式是1年左右理论基础，1年左右临床，1年左右科研实验，必须参与科研实验，且毕业时要提交科研课题数据、论文等，以培养具有良好基础医学知识的医学研究型人才（研究员）为主，硕士毕业后就业基本上分布于各医院相关研究机构亦或医院相关行政机构，读博的难度较小，一般均有机会直接申请读博，读博时可选择继续科研，或者着重临床。
注：
1、各地院校的培养模式不尽相同，就当地的具体需求和医疗管理模式而定。
2、对于科研实力一般，但病源较为充足的医学院校，导师倾向于接收临床型硕士研究生；对于科研压力较大，经费较充足的临床重点学院，学术型硕士研究生的名额相对较多。
4、如果你有读博的计划，尽量选择学术型硕士研究生。
3、并不是所有学硕都在硕士学习阶段能有临床实践机会，如北京地区，基本不允许学硕进临床实践，基本三年都以实验室为主战场。而上海地区，学硕进行临床实践的时间相对很多，由于现上海试点社区医疗，现上海地区着重发展社区住院医师培养模式，对于致力于扎根上海的专硕生是一个不错的选择。而在其它地区的大部分医院院校，专硕和科硕的区别并不大，很多院校还处在二者共同培养的模式。
4、你可以先确定院校，然后就目标院校的情况向目标院校的师兄师姐们详细了解比较稳妥。
（预祝你考研成功，加油↖(^ω^)↗）
追问如果能考上研究生我有考博的意愿。我也知道科硕考博有优势，但是刚才看到2012年的执业医师资格证报名规定，上面写得科硕不能考证，我还是想当医生不想当研究员
追答建议你选择专硕，就我所在医学院附属医院师兄师姐们的情况来说，专硕本校读博还是很多，或者你导师很牛的话直接推荐你保外读博也不少，不过貌似有些专业稍有变化，并不与研究生所读专业完全一致。