554和555 鹤之神秘路程
（加粗文字表示特别篇，带“◆”表示动画原创）
001 云霄飞车杀人事件 （前期成员第一次到齐）
003 偶像密室杀人事件
004 大都会暗号地图事件（少年侦探团正式成立并第一次破案）
005 新干线大爆破事件
006 情人节杀人事件◆
012 步美绑架事件（少年侦探团的成员配备阿笠博士制作的臂章）
014谜样的讯息狙击事件
015 消失的尸体杀人事件
017 百货公司挟持事件◆
020 鬼屋杀人事件
033 侦探团生还事件◆
036 周一晚上7：30分杀人事件◆
049 外交官杀人事件（后篇）
050 图书馆杀人事件
059 首次跑腿杀人事件◆
063 大怪兽哥美拉杀人事件
073 少年侦探队遇难事件◆
080 放浪画家杀人事件◆
081 当红艺人绑架事件（前篇）
082 当红艺人绑架事件（后篇）
086 诱拐现场特定事件
091 抢匪住院事件
095 小五郎约会杀人事件◆
107 鼹鼠星人之谜事件（前篇）◆
108 鼹鼠星人之谜事件（后篇）◆
109 侦探团大追踪事件◆
112 帝丹小学7大离奇事件
119 假面超人杀人事件◆
123 天气预报小姐绑架事件◆
126 旅行剧团杀人事件（前篇）◆
127 旅行剧团杀人事件（后篇）◆
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件（灰原哀加入少年侦探团）
130 竞技场无差别胁迫事件（前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件（后篇）
135 消失的凶器搜索事件◆
136 青色古堡探索事件（前篇）
137 青色古堡探索事件（后篇）
138 最后上映的杀人事件（前篇）
139 最后上映的杀人事件（后篇）
140 SOS！步美传达的讯息◆
146 本厅刑事恋爱物语（前篇）
147 本厅刑事恋爱物语（后篇）
148 路面电车急刹车事件◆
156 本厅刑事恋爱物语2（前篇）
157 本厅刑事恋爱物语2（后篇）
162 飞天密室 工藤新一最初的事件
163 月与星与太阳的秘密（前篇）
164 月与星与太阳的秘密（后篇）
165 少年侦探团消失事件◆
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
179 咖啡店货车闯入事件◆
182 九门大搜索◆
183 危险的处方笺◆
188 危命的复活 洞窟中的侦探团
189 危命的复活 负伤的名侦探
192 危命的复活 新一回来了
194 意味深长的八音盒（前篇）
205 本厅刑事恋爱物语3（前篇）
206 本厅刑事恋爱物语3（后篇）
209 龙神山汽车坠落事件◆
212 蘑菇、山熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山熊和侦探队（后篇）
225 生意兴隆的秘密◆
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
233 无法消失的证据（前篇）
234 无法消失的证据（后篇）
242 元太的灾难
246 陷入网中的谜团（前篇）
247 陷入网中的谜团（后篇）
252 图画中的绑架犯◆
257 世间奇妙的天罚◆
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
266 情人节的真相（事件篇）
269 犯罪的纪念品（前篇）
270 犯罪的纪念品（后篇）
273 提问婆婆失踪事件◆
276 警察手册丢失事件◆
279 迷宫的阴暗（前篇）
280 迷宫的阴暗（后篇）
281 年幼的目击者◆
289 迷途森林的光彦（前篇）
290 迷途森林的光彦（后篇）
294 爱与决心的粉碎（前篇）◆
295 爱与决心的粉碎（后篇）◆
301 恶意与圣者的行进（前篇）
302 恶意与圣者的行进（后篇）
303 回来的受害者
304 震动的警视厅 1200万人质
312 染上夕阳的布偶（前篇）
313 染上夕阳的布偶（后篇）
321 消失的绑架逃逸车（前篇）◆
322 消失的绑架逃逸车（后篇）◆
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
335 东京现影所的秘密（前篇）
336 东京现影所的秘密（后篇）
346 寻找屁股上的印记（前篇）
347 寻找屁股上的印记（后篇）
348 爱与幽灵与地球遗产（前篇）◆
349 爱与幽灵与地球遗产（后篇）◆
352 钓鱼大会的悲剧（前篇）◆
353 钓鱼大会的悲剧（后篇）◆
358 本厅刑事恋爱物语5（前篇）
359 本厅刑事恋爱物语5（后篇）
360 不可思议的春甲虫◆
363 都市的乌鸦◆
366 显而易见的码头惨剧（前编）
367 显而易见的码头惨剧（后编）
369 好运男子的历险◆
370 失而复得的游戏软件◆
373 剧毒蜘蛛的陷阱◆
374 星星和香烟的暗号（前篇）
375 星星和香烟的暗号（后篇）
376 限时15时◆
377 桃太郎解谜之旅（前篇）◆
378 桃太郎解谜之旅（后篇）◆
390 本厅刑事恋爱物语6（前篇）
391 本厅刑事恋爱物语6（后篇）
394 奇异屋宇的大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
401 宝石强盗现行犯（前篇）
402 宝石强盗现行犯（后篇）
403 不可思议的天使之馆（前篇）◆
404 不可思议的天使之馆（后篇）◆
409 同时进行的舞台表演和诱拐行动（前篇）◆
410 同时进行的舞台表演和诱拐行动（后篇）◆
411 神社鸟居的惊人暗号（前篇）
412 神社鸟居的惊人暗号（后篇）
414 追逐青鸟的侦探团◆
418 糀町阁楼的房屋◆
421 银杏叶色的初恋（前篇）
422 银杏叶色的初恋（后篇）
423 侦探团与青虫4兄弟◆
425黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间（这集在开始片花里出现了一下）
427 充满神秘的上学之路（前篇）
428 充满神秘的上学之路（后篇）
435 以侦探团为焦点的专访（前篇）
436 以侦探团为焦点的专访（后篇）（班主任小林澄子老师申请成为侦探团的顾问）
440 极限赛车表演◆
442 被钢筋阻止的男人◆
443 叹气拾潮（前篇）
444 叹气拾潮（后篇）
453 因缘与友情的试映会
454 颠倒的结尾（前篇）
455 颠倒的结尾（后篇）
459 怪人 循规蹈矩的男人◆
460 1年B班大作战
461 消失的一页◆
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
468 池塘边的奇怪事件◆
472 工藤新一少年时的冒险（前篇）
473 工藤新一少年时的冒险（后篇）
476 元太的必杀射门（前篇）
477 元太的必杀射门（后篇）
481 山妖婆婆的利刃（前篇）
482 山妖婆婆的利刃（后篇）
483 消失的巡警◆
488 电视台的恶魔
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
507 KTV包房的死角（前篇）
509 红白黄色与侦探团
510 柯南vsW暗号之谜
515 怪盗KID的瞬间移动魔术
518 明治维新神秘之旅（探索篇）◆
519 明治维新神秘之旅（解读篇）◆
524 讨厌的蓝色火花（前篇）
525 讨厌的蓝色火花（后篇）
533 呼唤过去的伤痕
534 新的伤痕与吹口哨的男人
535 旧伤痕与刑警之魂
536 消失的名画的秘密◆
542 让鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 让鱼儿消失的一角岩（后篇）
549 回转寿司之谜（前篇）
550 回转寿司之谜（后篇）
551 犯人是元太的父亲（前篇）
552 犯人是元太的父亲（后篇)
554 鹳的探索之旅(兰追踪篇)◆
555 鹳的探索之旅(阳菜追踪篇)◆
563 侦探团VS强盗团(骚乱)
564 侦探团VS强盗团(沉默)
565 没有看见的目击者◆
568 白鸟警部，樱花的回忆(前篇)
569 白鸟警部，樱花的回忆(后篇)
571 妖怪仓库中的夺宝战斗(前篇)
572 妖怪仓库中的夺宝战斗(后篇)
577 萤火虫点亮的真相◆
578 召唤危机的红色凶兆(前面部分）
583 小林老师之恋
584 白鸟警部的失恋
585 跨越时空的樱花之恋
586 黑暗中消失的麒麟之角
587 基德vs四神侦探团
591 水族馆之家
597 蒸汽密室的剧本(前篇)
598 蒸汽密室的剧本(后篇)
606 法庭的对决Ⅳ审判员是小林澄子（前篇）◆
607 法庭的对决Ⅳ审判员是小林澄子（后篇）◆
614日记演奏的秘密（前篇）
615日记演奏的秘密（后篇）
622 紧急事态252（前篇）
623 紧急事态252（后篇）
624 初恋的视频信件
未制作成动画的漫画
FILE.759 狼来了少年
FILE.760 诹坊湖的毛蟹
FILE.761 和歌纸牌的真相
FILE.764 时间的支配者
FILE.771 听听你的名推理
FILE.772 绰号之规则
FILE.773 有狙击的可能！
FILE.774 没有被翻过的书
FILE.775 视频网站
FILE.776 罐子和猫
FILE.777 步美的痕迹
OVA版
OVA1- 柯南 VS 基德 VS 阿剑！宝刀争夺大作战!
OVA2-16个嫌疑犯
OVA3-柯南与平次与消失的少年
OVA5-目标是小五郎!少年侦探团秘密 报告
OVA7-来自阿笠的挑战书!阿笠vs柯南vs少年侦探团
OVA8-女子高中生侦探·铃木园子的事件簿
OVA9-十年后的陌生人
OVA10-怪盗基德孤岛决战
OVA11-来自伦敦的绝密指令
剧场版
Movie1-引爆摩天楼
Movie2-第十四个目标
Movie3-世纪末的魔术师
Movie4-瞳孔中的暗杀者
Movie5-通往天国的倒计时
Movie6-贝克街的亡灵
Movie7-迷宫的十字路口
Movie8-银翼的魔术师
Movie9-水平线上的阴谋
Movie10-侦探们的镇魂歌
Movie11-绀碧之棺
Movie12-战栗的乐谱
Movie13-漆黑的追踪者
Movie14-天空的遇难船
Movie15-沉默的15分
剧场版特典
M09特典－水平线上的毛利小五郎
M10特典－柯南感恩十周年
M12特典—工藤新一 迷之墙和黑色拉布犬事件
M13特典—新一与兰 七夕节与麻将牌的回忆
M14特典—通往大阪什锦煎饼艰险之路（后面一小点）
M15特典—新潟 东京礼物狂想曲
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考