首先要做好清洗肠子的准备，医生会让病人用泻剂，目前临床上比较常用的是聚乙二醇电解质散剂，吃了就会有排泄的效果。在肠内粪便排出干净后，可以在肠镜下发现早期的微小病变避免漏诊。
为什么做肠镜？
一般年轻人的身体状况都比较健康，对检查的承受能力比较强，年轻人可以做心电图检查，以判断心脏功能。年长的人可能需要做更多的准备，除了肠道准备之外，还可以做一些心电图、肺功能检查等初步的心肺功能评估。病人自身有心脏病或心律失常及心功能异常时，应根据病人的具体情况进行心脏彩超、动态心电图检查。要知道病人的肝、肾功能，有没有电解质紊乱、明显贫血等。结合病人的年龄，根据基础病变情况，进行其它检查。
患有严重心脏疾病、严重的心脏疾病、严重的高血压、急性腹泻、严重的溃疡性结肠炎、结肠克罗恩病、腹膜炎、妊娠、精神病等，都是被禁止做肠镜的。做内窥镜检查之前，要了解病人是否存在血液感染疾病，如乙肝丙肝艾滋病梅毒等。若有以上疾病，则需对内镜消毒，并符合消毒质控标准后，方可再次使用。
什么是肠镜？
肠镜是一种直径约1厘米的细长可弯曲的医疗仪器，结肠镜进入直肠直到大肠，医生就能看到结肠和大肠的内部结构。对于大肠和结肠内病变，医生可以使用结肠镜检查。原肠镜检多用于检疫，与现代肠镜相比较为简单。现代化的肠镜都有很多摄像机，而且体积很大，可以深入到更深的地方进行检查。结肠镜利用一条长140 CM左右的纤维软管，末端装有光源带微型电子照相机，缓慢地进入大肠，检查大肠部位的病变、肿瘤或溃疡，如果有必要的话，可以做结肠息肉切除。
肠镜检查之前需要做相关的准备工作，具体如下：
一、要提前4-6个小时做清肠准备，也就是在肠镜检查之前需要通过口服泻剂来将肠道内的粪便完全排出干净，有利于在检查的过程中仔细的观察肠道黏膜病变，同时可以避免不清洁的肠道影响检查的顺利完成，所以需要在肠镜检查之前4-6小时口服清肠泻剂，完成肠道的准备工作。
二、保持心情平静，避免紧张的情绪。肠镜检查，尤其是普通肠镜检查会有一定腹痛、腹胀等腹部不适的表现，所以在检查前要放松心情，避免因过度紧张，导致心跳增快、血压上升或者肠道过度痉挛，而影响检查的结果和顺利的完成。
三、对于有心脏以及中枢神经系统基础病变的患者，需要完善心电图、头部CT检查来判断其具体的病变情况，以避免在检查的过程中因为腹痛等刺激症状诱发基础疾病。
四、如果是做无痛肠镜检查，还需要麻醉医师来进行麻醉前的评估工作，以顺利完成无痛肠镜检查
第二、保持心情平静，避免紧张的情绪。肠镜检查，尤其是普通肠镜检查会有一定腹痛、腹胀等腹部不适的表现，所以在检查前要放松心情，避免因过度紧张，导致心跳增快、血压上升或者肠道过度痉挛，而影响检查的结果和顺利的完成。
第三、对于有心脏以及中枢神经系统基础病变的患者，需要完善心电图、头部CT检查来判断其具体的病变情况，以避免在检查的过程中因为腹痛等刺激症状诱发基础疾病。
第四、如果是做无痛肠镜检查，还需要麻醉医师来进行麻醉前的评估工作，以顺利完成无痛肠镜检查。