不一定，井水有井水的好处，而自来水也有自来水的好处。总的来说只要对人体没有多大的危害一般都是比较干净的水，毕竟现在所有的水基本上都要经过加热处理才会被人体饮用。
井水的益处首先是完全免费，其次是假如周围并没有污染物来源，是天然的水。弊端首先是并没有经由消毒杀菌加工处理，其次，周围很有可能有工厂违反规定排放污染物来源到地下，最后，天然降雨中也很有可能具有污染物来源。因此 井水很有可能具有化学污染物来源和病菌，对身体健康不利。
官方的说法是，并没有经由消毒杀菌或检测的地下水资源不可以作为直饮水标准。日常自来水一般是江河水，也有地下水资源，或是两者的混合。不过所有日常自来水全部都是经由消毒杀菌并进行过滤过的。再经煮沸或家用饮水机的进行过滤，可以达到食用标准。因此 ，井水尽量只是用于浇花、洗衣、冲洗院子，而日常自来水较为适合食用。
日常自来水经由水厂进行过滤、净化、消毒杀菌等各项加工处理，水中杂质残渣成分较少。而井水则没有经过任何加工处理，一般具有较多杂质残渣，尤其是钙镁离子成分较高，假如井周围土地遭受污染，有害杂质残渣成分会更高一些。日常自来水是地面水经由自来水厂多方面加工处理（如沉淀，消毒杀菌，净化等），各项指标都达到我国直饮水标准，因此喝起来较为安心。
井水是地下水资源，从某种程度上讲，它比日常自来水要干净。因为它所遭受的污染较小（不像地面水），日常自来水虽经由加工处理达标，那也是相对的，是我国依据人体所能接受的标准或是依据加工处理技术所能达到的程度来制订的。
井水最大的特点便是硬度较高，也就是钙、镁离子的成分较高，但这对人体并没有任何危害，现在不是还在拼命地宣传补钙嘛。倒是对你烧水的铝壶有危害，因为它较为容易积垢。通常情况下，水井里的水几乎没有污染，水的质量较好，并没有经由任何加工处理。
日常自来水多取自大河，水的质量较差，但有经由沉淀、进行过滤、杀毒等加工处理。城里的用水便是日常自来水了，那种日常自来水经由日常自来水处理厂净化、消毒杀菌过，是较为安全的。