身高基因是生物体遗传信息中与生物体身高有关的基因。科学家研究表明：基因遗传是决定身高的主要因素，表现为多基因遗传。父母如果个子高，孩子很可能个儿也高。 基因和环境因素（如营养和锻炼）都对人的肥胖程度有重要影响，但身高却有大约90%一——是取决于基因。《自然遗传学》杂志上的一篇论文反映：英国和美国研究人员通过全面的分析，他们发现了一种名为HMGA2的基因，是控制身高的基因之一。人类身高差异中仅有O．3%能归因于HMGA2基因，其它身高基因还有待发现。
科学家宣布，他们发现了首个有助于解释人类中常见的身高差异的基因。 们说，这个基因的DNA编码稍作改变，就会使人的身高相差多达1厘米。但他们补充说，另外数百个基因很可能也影响到人的身高。人们早就知道，尽管身高与基因之间显然存在联系，科学家却一直未能发现人类共有的“身高”基因，直到现在才在一小群人身上找到基因影响身高的惟一证据。
根据发表在《自然遗传学》杂志上的一篇论文，英国和美国研究人员分析了具有欧洲血统、主要生活在英国、瑞典和芬兰的近5000名白人的DNA。通过全面的分析他们发现了一种名为HMGA2的基因。HMGA2的基因编码中，仅仅一个“字母”的变化——从T(胸腺嘧啶)变成C(胞嘧啶)——就会使从双亲身上都遗传到这种改变的人身高高出近1厘米。仅从父母中的一方遗传到“C”的人则比获得两个“T”的人高出约半厘米。
控制身高的不是单个基因，而是很多基因，它们之间没有明确的显隐性关系，但有有效基因和无效基因之分。身高性状的表达，看个体基因型中控制身高的有效基因的多少！有效基因多，表现身高就高，反之则反，表现为数量遗传。
父母对孩子身高的影响，要看他们形成的性细胞（精子和卵子）中贡献出来的有效基因的多少，而不是简单的看他们表现出来的身高。 概率是相等的，也有可能是二者的自由组合，或者更好，或者也有可能更坏，归根结底就是先天性对身高来说具有很大的偶然性！但是这孩子在婴幼儿时期的营养如果能够比较充足的话，他的身高会受到很大的影响，也就是说身高跟后天的营养条件有很大的关系！不完全由基因决定的！
