法律分析：农合住院检查费当然可以报销，具体的报销比例按不同级数的医院来评定，村卫生室、村中心卫生室就医报销60%，每次就诊处方药收费限额10元，医院医生临时补液处方费50元。镇卫生院就医报销40%，每次就诊检查费和手术费限额为50元，处方药费为100元。二级医院报销30%，每次就诊检查费、手术费限额50元，处方药费200元。三级医院报销20%，每次就诊检查费和手术费限额50元，处方药费200元。每种膏药的处方限额为1元，附在中药发票上。乡镇合作医疗门诊年补偿限额为5000元。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条 职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
第二十四条 国家建立和完善新型农村合作医疗制度。
新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。