大兴机场离京雄城际铁路大兴机场站近。隶属中国铁路北京局集团有限公司管辖，大兴机场站地下一层为站厅层，地下二层为站台层，设置2台6线。设计采用“上进上出”的流线模式，进站换乘京雄城际先由地面航站区进入地下一层换乘通廊，通过开放式进站口进站检票进入地下二层站台乘车；出站值机的在地下一层南北区出站，通过换乘通廊向上进入航站楼。京雄城际铁路与城际联络线、地铁构成轨道交通站厅层，在地下一层换乘通廊可实现换乘，并进入站台乘车。
大兴机场站地铁站位于B1层，是北京地铁大兴机场线的终点站，可通过北京地铁大兴机场线前往草桥站换乘北京地铁10号线。北京地铁大兴机场线运营时间为6:00-22:30，发车间隔为8.5分钟-10分钟。