能。
口袋都是card2类型，存档是在rom里的
修改方法：
安装savedatafiler.cia后在GW模式下，先不要运行，按SELECT选择口袋ROM，只要读取（就是界面有显示口袋的图标），不要运行。在有显示口袋图标的情况下运行，进入后下屏最上面会有“User”“ExtData“”SD”三个界面，在“User”界面下选择“CTRCard“按Y键，这样就会导出存档文件到SD卡了。
把SD卡连接电脑打开pkhex汉化版0.9，点击“文件”-“读取”，选择SD卡里的filer\UserSaveData\（你导出存档的时间为名的文件夹）\000011c5（这个不知道大家是否会不同，反正就一个文件夹，进去就是）\main。
然后就可以开始修改了，在“主界面”下的“种类”选择自己要的精灵，修改好各数据后在右边界面的“箱子”或“队伍”里右键选择"SET"就会出现你修改的精灵了。选择pkhex右边界面的“保存”，然后选择“输出SAV”，覆盖掉导出的main存档（记得备份）。
把SD卡装回3DS，进入GW，同样的让口袋ROM的图标显示出来，然后运行，这次按十字键→跳到“SD”界面。然后选择存档文件按A键确认导入存档。