上海自贸区注册企业优惠政策如下：
1、投资行业限制放宽。负面清单出台，允许投资清单以外的行业；非禁即入，凡是法律法规没有禁止的，都列为开放；
2、金融领域的改革创新。金融市场利率市场化、汇率市场化、金融市场产品创新；人民币资本项目可兑换进行先行先试；推动金融服务对民营资本和外资的全面开放；允许部分中资银行从事离岸业务；
3、税收优惠。符合鼓励类，所得税减按15%征收；出口退税政策完善；
4、贸易领域：通关制度和手续简化，创新监管模式，将一线监管集中在对人的监管，口岸单位只做必要的检验检疫等；特别是海关方面将不再采用批次监管的模式，而采用集中、分类、电子化监管模式。
《关于中国(上海)自由贸易试验区内企业登记管理的规定》
第十条 试验区内外商投资广告企业的项目审批和设立分支机构审批，实行备案制。试验区内新设立外商投资广告企业的，以及设立后更换合营方或转让股权、变更广告经营范围和变更注册资本的，由申请人在申请办理设立、变更等登记事项的同时，向自由贸易试验区分局提交备案材料；试验区内外商投资广告企业在试验区外设立分支机构的，在取得分支机构营业执照后7个工作日内，向自由贸易试验区分局提交备案材料。第十二条 申请人可以根据需要，通过电子数据交换或者现场的方式申报企业登记、外商投资企业审批（备案）、组织机构代码证办理和税务登记。登记机关统一接收申请人向各职能部门提交的申请材料，统一送达相关证照及文书。第十五条 登记机关对企业年度报告进行抽查，在检查中发现或者事后接举报查实企业有违法行为、申报不实隐瞒真实情况或者虚假承诺的，责令限期改正，并将企业纳入不良信用体系；对有违反企业登记管理规定行为的，除责令改正外还可以依照有关企业登记管理规定予以处罚，并将企业法定代表人、负责人等信息通报相关部门。