1、运算速率，FX3U是最快的。
2、通讯口：FX3U可以同时使用3个。
3、高速脉冲输出：FX3U系列PLC可以控制3轴,比FX2N多一轴。
4、FX3U扩展点数也比FX2N的多，并且FX2N的程序可以直接导入FX3U同等型号的PLC中。对机器没有影响！
5、FX3U与FX2N接线最大的区别在于，3U有S/S端，通过S/S端可以对PLC变为漏型输入或源型输入，FX2N就没有此功能。
扩展资料：
FX2N是从16路到256路输入/输出的多种应用的选择方案；FX2N系列是小型化，高速度，高性能和所有方面都是相当于FX系列中最高档次的超小形程序装置。除输入出16-25点的独立用途外，还可以适用于在多个基本组件间的连接，模拟控制，定位控制等特殊用途，是一套可以满足多样化广泛需要的PLC。
在基本单元上连接扩展单元或扩展模块，可进行16-256点的灵活输入输出组合。可选用16/32/48/64/80/128点的主机，可以采用最小8点的扩展模块进行扩展。可根据电源及输出形式，自由选择。
程序容量：内置800步RAM（可输入注释）可使用存储盒，最大可扩充至16K步。丰富的软元件应用指令中有多个可使用的简单指令、高速处理指令、输入过滤常数可变，中断输入处理，直接输出等。便利指令数字开关的数据读取，16位数据的读取，矩阵输入的读取，7段显示器输出等。
数据处理、数据检索、数据排列、三角函数运算、平方根、浮点小数运算等。特殊用途、脉冲输出，脉宽调制，PID控制指令等。外部设备相互通信，串行数据传送，ASCIIcode印刷，HEXASCII变换，校验码等。时计控制内置时钟的数据比较、加法、减法、读出、写入等。
参考资料：