如果您使用二维码收款方式，并且发现收款金额在第二天才合并到账户余额中，您可以按照以下方式进行账务处理：
在收款当天，将收款金额记入“应收账款”账户中，相应地增加该账户的余额。
在第二天，将收到的金额从“应收账款”账户中转出，转入实际收款账户，同时减少“应收账款”账户的余额。
如果合并到账金额中有手续费的扣除，需要将手续费记入“手续费”账户中，并在“应收账款”中扣除相应的手续费，确保账务处理的准确性。
需要注意的是，由于二维码收款方式的结算时间可能会有所延迟，因此建议在账务处理中注意记录实际收款时间，并及时更新账户余额。同时，在账务处理过程中，应当遵守会计准则和相关法律法规的规定，确保账务处理的准确性和合法性。如果对账务处理存在疑问，建议及时咨询会计师或税务专业人士的意见。