一、苗木来源杂，质量无保障
苗木多数为果农从小型集市上购买，每株0.4～0.5元，个别果园为育苗基地繁育。果农倾向购买价格低的苹果苗，育苗基地和育苗户也希望通过缩短育苗周期获得高收益，因此建园使用的矮化苹果苗多数为2年生苗，苗木质量低，适应性差，树势弱，结果晚。建成的矮化密植园5～6年才开始结果，晚于试验园和示范园1～2年。有些果农栽植这类苹果苗后进行再嫁接自己觉得品质好的品种，还有些果农不相信苹果苗的品种，进行改接。致使有些矮化苗形成根砧-矮化砧-品种1-品种2的4段苗。
二、病毒病种类多，复合侵染率高
实验室检测数据显示，矮化密植园花叶病发病率在10%～50%，高于乔化园；三大潜隐病毒中每种病毒的发生率均在80%以上，且为复合侵染。这些病毒复合侵染导致矮化树生长势减弱，也会使果树早衰，同时影响果品的产量与品质。
三、锈果类病毒发生率高，严重影响果实品质
在调查的矮化密植园中，果农自述锈果病株比较常见，我们的检测结果显示，果农发现有花脸病的病株全部带有锈果类毒，随机采集的样品带毒率高于60%，显著高于乔化园。锈果病(也称花脸病)对苹果果实品质和商品价值影响最大，该种类病毒仅在果实上有可见症状，在叶片、枝干等器官上均没有症状，所以这种病毒病不仅危害大而且隐蔽性强。同时该病害通过嫁接、修剪和根接在果园中传播，是苹果病毒中传播水平最快的一种，很容易导致毁园。
四、果农急需栽培管理技术支持和服务
通过调查中对比试验园(包括示范园)和普通园，两种管理类型园子在果树长势、树形、生长一致性、产量等多方面差异非常明显，果农收益悬殊，相差1～3倍。有些普通果园因管理不良有乔化趋势，造成果园密闭。果农对矮化密植树形的管理缺乏经验，迫切需要得到栽培管理和病虫害防治技术指导。
五、果农迫切需求无毒苗或脱毒苗，但没有购买途径
由于近些年来苹果价格稳中有升，果农收益良好，吸引了许多人开始种植苹果树或对老旧园更新。果农对无毒苗或脱毒苗比较认可，但苗木市场比较混乱，一是各家都说自家的苹果苗是脱毒苗甚至无毒苗，但没有相应的准入、认证和检测凭证，造成苹果苗良莠混杂，果农无从区分；二是苗木价格差异较大，从1元1株到十几元1株，多数果农仅考虑投资成本，购买比较便宜的苹果苗；三是有保证的无毒苗和脱毒苗供应量太少，多数果农没有途径或根本不知道在哪里能买到真正的健康苹果苗。
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