俄罗斯空军现编为7个战役司令部，构成“战役司令部-空军基地（旅）-大队（团）”三级指挥结构。第1空防司令部归西方军区指挥，第2空防司令部归中央军区指挥，第3空防司令部归东方军区指挥，第4空防司令部归南方军区指挥。
第1空防司令部
驻沃罗涅日
第6961空军基地（装备苏-27歼击机，驻贝索韦茨）；
第6964空军基地（装备苏-24和苏-24MP前线轰炸机，驻蒙切戈尔斯克）；
第6965空军基地（装备米-8和米-24直升机，驻维亚泽马）；
第7000空军基地（装备苏-24M、苏-24MP和苏-34前线轰炸机，驻沃罗涅日）。
第2空防司令部
驻叶卡捷琳堡
第6979空军基地（装备米格-31歼击机，驻堪斯克）；
第6980空军基地（装备苏-24M前线轰炸机，驻车里雅宾斯克）；
第6982空军基地（装备米格-29歼击机，驻多姆纳）。
第3空防司令部
驻哈巴罗夫斯克
第6983空军基地（装备苏-25强击机、米-8和米-24直升机，驻沃兹德维任卡）；
第6987空军基地（装备苏-27SM歼击机，驻泽姆基）；
第6988空军基地（装备苏-24M、苏-24M2和苏-24MP前线轰炸机，驻呼尔巴）；
第6989空军基地（装备苏-27SM歼击机，驻中乌戈洛瓦亚）；
第265运输航空基地（驻哈巴罗夫斯克）。
第4空防司令部
第6970空军基地（装备苏-24M前线轰炸机，驻摩罗佐夫斯克）； 第6971空军基地（装备苏-25SM强击机、米-8、米-24和米-28直升机，驻布琼诺夫斯克）； 第6972空军基地（驻克里木斯克）； 第6974空军基地（装备米-8、米-24和米-28直升机，驻科列诺夫斯克）； 第6977空军基地（装备米格-31歼击机，驻彼尔姆）； 第999空军基地（装备苏-25强击机、苏-27和米-8直升机，驻坎特）； 第229运输航空基地（驻顿河畔罗斯托夫）。 空天防御司令部
驻莫斯科
第6963空军基地（装备米格-29SMT歼击机，驻库尔斯克）；
第6968歼击机空军基地（装备苏-27和米格-31歼击机，驻霍季洛沃）。
军事航运司令部
驻莫斯科
第6955空军基地（装备伊尔-76运输机，驻特维尔）；
第6956空军基地（装备伊尔-76运输机，驻奥伦堡）；
第6958空军基地（装备伊尔-76运输机，驻塔甘罗格）；
第6985空军基地（装备伊尔-76运输机，驻普斯科夫）。
远程航空兵司令部
驻莫斯科
第6950空军基地（装备图-22M3远程轰炸机、图-95MS和图-160战略轰炸机，驻恩格斯）；
第6952空军基地（装备图-95MS战略轰炸机，驻乌克拉因卡）；
第6953空军基地（装备图-22M3远程轰炸机，驻斯列德尼）。
